Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr9
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  48574783

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   

This is table  59  of  135  ( 16172 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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20
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2
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1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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2.3
25
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39
1.49
24234274--24234351
28
2.7
28
86
7
95
39
10
5
44
1.60
24243993--24244036
20
2.2
20
91
0
70
22
6
29
40
1.80
24247139--24247175
18
2.1
18
89
0
56
67
0
29
2
1.04
24251456--24251480
10
2.5
10
100
0
50
92
8
0
0
0.40
24257913--24258087
88
2.0
90
87
3
255
41
7
25
26
1.81
24261976--24262016
21
2.0
21
85
9
57
65
4
0
29
1.13
24262816--24262889
37
2.0
37
100
0
148
35
2
16
45
1.61
24265816--24265852
18
2.1
18
94
0
65
27
18
18
35
1.95
24273680--24273704
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
24284652--24284695
18
2.5
17
82
10
52
52
4
2
40
1.34
24286695--24286772
38
2.1
38
85
7
106
32
29
7
30
1.85
24287117--24287178
30
2.1
30
93
0
106
33
14
14
37
1.87
24298859--24299370
102
5.0
102
99
0
1006
25
16
17
39
1.91
24309968--24309992
12
2.1
12
100
0
50
92
0
8
0
0.40
24310037--24310378
118
3.0
115
91
7
556
34
11
5
49
1.61
24310271--24310588
178
1.8
174
96
2
591
35
11
5
47
1.62
24325080--24325104
12
2.1
12
100
0
50
32
8
0
60
1.26
24330525--24330588
21
3.0
22
72
9
69
37
25
18
18
1.94
24336415--24336444
12
2.5
12
94
0
51
60
3
0
36
1.14
24338605--24338879
137
2.0
137
97
0
514
26
13
14
45
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24346150--24346189
18
2.2
18
90
0
62
27
5
47
20
1.70
24353568--24353635
32
2.1
33
94
2
120
29
10
2
57
1.47
24355423--24355468
19
2.3
20
85
7
67
43
0
4
52
1.21
24356086--24356261
20
9.1
20
69
15
93
60
7
2
28
1.38
24356103--24356291
95
2.0
96
98
1
371
58
7
3
30
1.41
24356354--24356382
10
2.9
10
100
0
58
62
0
0
37
0.96
24356655--24356692
19
2.1
18
90
5
58
21
0
2
76
0.91
24371913--24371999
1
87.0
1
72
0
57
85
11
2
1
0.76
24371916--24371999
17
4.8
17
80
10
80
84
11
2
1
0.78
24371912--24371996
35
2.4
34
84
7
109
83
12
2
1
0.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135