Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 ID=Chr09-JGI_221_v2.0
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70713020

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  225  of  226  ( 27023 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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289
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14
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1.48
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Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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2.0
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5
29
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
70420100--70420202
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3.6
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97
0
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23
12
24
39
1.89
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0
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10
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1.58
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25
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54
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2.2
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14
3.1
14
80
16
58
78
2
2
17
0.94
70454359--70454405
15
3.1
15
84
6
67
78
2
2
17
0.94
70455035--70455060
5
5.2
5
100
0
52
80
0
0
19
0.71
70460639--70460685
19
2.5
19
76
13
53
31
4
0
63
1.13
70461864--70462196
178
1.9
176
84
3
452
47
9
13
29
1.74
70463537--70463567
4
7.8
4
100
0
62
77
0
22
0
0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70474431--70474476
21
2.2
22
92
7
78
56
8
10
23
1.61
70479117--70479147
14
2.2
14
94
0
53
19
0
3
77
0.90
70479184--70479221
13
2.7
14
88
8
51
65
0
0
34
0.93
70479193--70479221
15
2.0
15
93
6
51
68
0
0
31
0.89
70485052--70485129
22
3.5
22
85
0
111
29
14
25
30
1.94
70487128--70487172
3
15.0
3
85
0
63
35
0
2
62
1.08
70487455--70487523
2
35.0
2
77
8
61
42
2
1
53
1.24
70487444--70487523
19
4.2
19
79
7
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40
3
2
53
1.32
70487476--70487523
19
2.5
19
96
0
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37
4
2
56
1.30
70490681--70490736
2
28.5
2
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10
89
46
1
0
51
1.11
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24
2.0
24
91
0
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38
10
2
48
1.50
70490784--70490835
24
2.2
24
82
0
59
38
11
1
48
1.51
70492207--70492282
27
2.8
26
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11
82
40
2
0
56
1.13
70492252--70492284
17
1.9
17
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11
50
45
0
0
54
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2
19.0
2
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0
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50
0
0
50
1.00
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7
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7
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0
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0
0
11
0.52
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17
2.0
17
100
0
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35
11
5
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1.65
70542905--70542965
30
2.0
30
100
0
122
36
22
16
24
1.94
70543450--70543523
37
2.0
37
94
0
130
24
27
17
31
1.97
70550514--70550549
18
1.9
18
88
5
54
58
2
0
38
1.13
70550969--70551033
31
2.1
30
83
8
78
46
1
6
46
1.37
70556199--70556223
7
3.6
7
100
0
50
88
0
12
0
0.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70556619--70556663
18
2.4
19
89
10
67
37
0
0
62
0.96
70556619--70556673
18
2.9
19
76
17
60
41
0
0
58
0.98
70558633--70558713
38
2.1
38
93
0
135
40
6
20
32
1.77
70567134--70567169
2
18.0
2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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2.3
30
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2
102
32
14
7
45
1.73
70575643--70575701
26
2.2
27
82
14
70
38
28
18
13
1.89
70592379--70592448
34
2.1
33
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7
106
55
11
5
27
1.57
70592552--70592593
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2.0
21
100
0
84
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14
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14
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20
62
22
8
5
63
1.44
70605515--70605568
25
2.2
26
100
0
94
53
7
3
35
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226