Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr09 ID=Chr09-JGI_221_v2.0
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  70713020

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   

This is table  44  of  226  ( 27023 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18619184--18619507
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70
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0
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83
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1
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63
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.96
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1.31
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342
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2.0
17
88
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0
0
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1.84
18726974--18727049
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28
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12
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2
2
41
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3.1
129
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19
24
33
1.97
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131
3.4
131
87
3
558
23
24
21
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18739497--18740199
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21
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1.98
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44
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22
22
23
31
1.98
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23
20
29
1.99
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2.5
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541
26
23
20
29
1.99
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164
26
23
21
28
1.99
18742960--18743012
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1.00
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3.5
22
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14
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27
0
25
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18801668--18801731
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28
0
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46
1.53
18802902--18803048
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3.8
38
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159
30
20
16
32
1.94
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63
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0
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15
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17
1.93
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2.0
37
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18
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30
25
33
10
1.89
18820518--18820558
17
2.5
16
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26
1.89
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17
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39
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1.88
18823964--18824155
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2.0
96
100
0
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18
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1.26
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222
26
0
14
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105
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30
0
13
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1.38
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25
19
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1.98
18860277--18860599
140
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145
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25
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1.98
18876240--18876264
13
1.9
13
100
0
50
48
0
16
36
1.46
18877266--18877312
18
2.7
18
78
21
55
57
0
6
36
1.24
18879142--18879180
20
2.0
20
84
0
51
25
15
20
38
1.92
18883597--18883630
16
2.1
16
100
0
68
23
20
17
38
1.93
18883653--18883723
3
23.0
3
91
5
106
32
2
2
61
1.24
18883779--18883816
18
2.1
19
90
5
60
42
7
0
50
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18883929--18883987
22
2.6
22
83
2
64
40
10
1
47
1.47
18888175--18888226
27
2.0
27
85
11
72
0
32
3
63
1.12
18888956--18889013
30
1.9
30
82
6
73
62
5
0
32
1.18
18889012--18889050
17
2.3
17
86
8
53
64
2
2
30
1.21
18889252--18889381
69
1.9
70
87
4
192
30
3
3
63
1.24
18889903--18889981
31
2.5
31
81
0
95
56
0
3
39
1.17
18896322--18896522
44
4.7
44
75
4
176
26
24
20
27
1.99
18896276--18896473
85
2.3
85
81
3
211
28
24
20
26
1.99
18912993--18913028
17
2.1
17
89
0
54
47
19
16
16
1.83
18913941--18914140
112
1.8
109
91
3
328
30
21
18
29
1.97
18916917--18917147
120
1.9
120
90
1
365
25
27
11
35
1.90
18922056--18922083
8
3.5
8
100
0
56
50
0
10
39
1.37
18922229--18922253
4
6.2
4
100
0
50
76
0
0
24
0.80
18927606--18927667
27
2.3
26
81
15
65
38
6
3
51
1.44
18927728--18927811
27
2.9
27
74
16
78
29
21
30
17
1.96
18927743--18927803
32
1.9
32
86
0
86
27
19
32
19
1.96
18927885--18927960
19
4.1
18
77
5
80
35
9
0
55
1.32
18927890--18927960
37
1.9
37
94
0
124
38
9
0
52
1.35
18928249--18928317
19
3.7
19
79
12
90
50
0
11
37
1.39
18928532--18928602
37
1.9
37
100
0
142
49
0
11
39
1.39
18928538--18928606
19
3.7
19
82
5
97
52
0
10
37
1.36
18928677--18928732
27
2.1
26
90
3
85
16
32
19
32
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18928683--18928741
27
2.2
27
84
0
73
13
28
25
32
1.94
18943030--18943110
25
3.3
25
82
1
92
18
27
22
32
1.97
18947730--18947795
19
3.6
19
79
4
73
40
1
0
57
1.08
18949544--18949594
27
1.9
26
84
4
66
31
25
13
29
1.94
18952905--18952945
2
20.5
2
100
0
82
51
0
0
48
1.00
18958598--18958643
12
3.8
12
80
5
56
15
23
15
45
1.84
18963905--18963944
16
2.5
16
87
0
53
85
2
7
5
0.83
18963918--18963949
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1.9
16
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0
15
3
0.82
18971903--18971930
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4.0
7
100
0
56
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0
0
28
0.86
18977025--18977060
18
2.0
18
100
0
72
27
16
22
33
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226