Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: CP032248.1 Gossypioides kirkii chromosome KI_06
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  60359545

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   

This is table  70  of  193  ( 23090 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22492368--22492554
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0
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0
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2.7
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40
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0
0
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0
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58
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0
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193
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1.78
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2.0
27
100
0
110
25
0
27
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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52
0
0
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1.00
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2.0
25
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21
1
7
68
1.25
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11
2.9
11
90
0
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1.96
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21
2.6
20
84
3
70
24
20
18
35
1.95
22564523--22564578
14
4.2
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23
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34
2.0
34
100
0
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79
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541
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16
29
28
1.97
22598979--22599529
198
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198
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687
24
17
29
28
1.97
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17
32
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18
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1.93
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112
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22
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62
2
22
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72
1.05
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12
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0
19
0
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16
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16
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57
0
19
0
80
0.70
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102
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290
33
14
16
35
1.89
22611554--22611601
23
2.1
23
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62
22
16
10
50
1.76
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98
4.6
98
83
3
526
36
16
27
19
1.93
22614261--22614635
49
7.8
49
68
8
212
36
16
28
19
1.93
22614262--22614707
195
2.3
191
84
3
536
36
16
27
19
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22614649--22615218
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4
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17
28
18
1.93
22614395--22615259
99
8.8
99
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3
638
36
16
28
18
1.93
22614648--22615259
297
2.1
298
81
3
723
36
16
28
18
1.93
22614651--22615330
297
2.3
297
80
4
712
36
17
28
18
1.93
22615616--22616641
42
25.0
41
84
8
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17
25
1.97
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125
84
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1136
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25
17
25
1.97
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14
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15
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4
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2
0
22
0.94
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103
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262
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11
13
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16
33
0
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0
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0
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2.0
54
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29
17
27
1.98
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20
3.1
20
73
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0
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0.93
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18
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23
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1.03
22666256--22666300
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20
20
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45
18
22
13
1.84
22674882--22674943
28
2.2
29
75
16
69
54
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22677172--22677196
7
3.6
7
100
0
50
28
12
0
60
1.32
22681082--22681127
23
2.0
23
87
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56
2
2
39
1.24
22685737--22685867
56
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181
45
16
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29
1.79
22691406--22691497
17
5.4
17
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123
41
1
3
54
1.24
22691406--22691497
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16.0
6
71
13
77
41
1
3
54
1.24
22691406--22691493
23
3.9
23
76
11
83
39
1
3
55
1.24
22691440--22691516
35
2.2
33
82
11
84
42
3
3
49
1.39
22692153--22692186
17
2.0
18
88
11
54
64
8
0
26
1.22
22693291--22693499
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29
74
13
110
34
28
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33
1.75
22693330--22693503
58
3.0
58
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183
35
25
2
36
1.71
22693410--22693508
29
3.4
29
79
12
85
34
30
2
33
1.69
22693439--22693577
69
2.0
68
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6
192
32
28
4
34
1.77
22693508--22693707
28
6.9
29
73
11
110
34
25
6
34
1.81
22693533--22693617
28
3.1
28
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111
34
27
3
35
1.74
22693512--22693617
58
1.9
56
82
7
135
35
24
4
34
1.77
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124
1.9
124
88
0
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36
19
23
20
1.95
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36
19
22
21
1.95
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2.1
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4
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36
18
22
22
1.95
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185
2.0
185
89
0
555
36
19
22
21
1.95
22707308--22707400
17
5.4
17
81
5
107
41
1
3
53
1.24
22707336--22707400
6
11.0
6
76
3
69
44
1
1
52
1.19
22708078--22708142
9
6.9
9
70
16
51
52
1
4
41
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22709119--22709348
29
8.0
28
78
12
209
35
29
2
32
1.71
22709111--22709348
58
4.1
58
80
5
250
35
28
2
33
1.72
22709128--22709468
29
11.7
29
73
14
204
33
25
6
34
1.81
22714982--22715029
3
16.0
3
95
0
87
66
2
0
31
1.03
22716215--22716253
19
2.1
19
100
0
78
30
15
0
53
1.42
22719196--22719508
154
2.0
154
87
1
448
30
22
22
25
1.99
22721730--22721773
23
1.9
23
86
9
63
75
0
18
6
1.02
22753155--22753183
15
1.9
15
100
0
58
31
13
27
27
1.94
22756403--22756432
15
2.0
15
100
0
60
60
0
6
33
1.23
22760611--22760688
18
4.2
17
71
28
61
19
0
6
74
1.03
22760611--22760693
30
2.9
28
75
13
80
20
1
6
72
1.13
22765421--22765567
69
2.2
66
82
6
163
57
10
18
12
1.64
22766804--22766941
15
8.6
16
68
21
83
76
2
21
0
0.94
22766814--22766906
8
11.2
8
74
10
80
79
0
19
1
0.79
22766805--22766914
31
3.5
30
77
19
109
78
0
20
0
0.87
22766806--22766937
44
3.0
43
77
12
119
75
2
21
0
0.96
22766803--22766906
17
5.6
17
70
21
75
79
0
19
0
0.78
22766802--22766908
35
3.1
35
80
9
112
78
0
20
0
0.81
22766802--22766865
5
12.8
5
78
15
62
81
0
18
0
0.70
22766803--22766913
24
4.5
24
76
13
91
79
0
18
0
0.84
22766803--22766943
58
2.5
60
76
19
151
75
2
21
0
0.95
22766804--22766908
13
7.1
15
71
22
80
79
0
20
0
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22767308--22767361
19
2.8
19
88
2
72
25
14
12
46
1.81
22767956--22768079
50
2.5
50
86
2
169
43
21
12
21
1.86
22768083--22768775
203
3.4
200
77
9
683
34
19
20
25
1.96
22768040--22768789
306
2.5
306
83
3
888
34
19
20
25
1.96
22768044--22768803
102
7.5
102
81
4
759
34
19
20
25
1.96
22769620--22769680
11
5.4
11
80
16
63
72
6
0
21
1.07
22769622--22769682
25
2.6
24
82
14
74
73
6
0
19
1.04
22769620--22769704
36
2.4
35
80
7
100
70
7
0
22
1.11
22769665--22769704
19
2.1
19
86
9
55
67
10
0
22
1.20
22772158--22772577
210
2.0
210
100
0
840
34
22
13
30
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193