Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr2
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  43198478

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   

This is table  43  of  131  ( 15627 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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14296377--14296590
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2.9
73
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258
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28
18
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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Indices
Period
Size
Copy
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Score
A
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(0-2)
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202
28
1
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14353174--14353198
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14353294--14353331
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14353242--14353385
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14353373--14353397
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14353493--14353530
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14353441--14353584
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14353572--14353596
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14353692--14353729
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14353640--14353783
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14353771--14353795
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14353891--14353928
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14353839--14353982
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14353970--14353994
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14354090--14354127
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14354038--14354181
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14354169--14354193
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14354289--14354326
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14354237--14354380
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14354368--14354392
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14354488--14354525
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14354436--14354579
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14354567--14354591
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14354687--14354724
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14354635--14354778
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14354766--14354790
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14354886--14354923
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14354834--14354977
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63
14354965--14354989
7
3.6
7
100
0
50
16
0
52
32
1.44
14355085--14355122
13
2.8
13
81
18
51
13
0
47
39
1.42
14355033--14355176
74
1.9
76
85
2
202
28
1
26
43
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131