Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D03
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  53248092

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  46  of  175  ( 20966 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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10
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2
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2.3
20
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25
29
12
31
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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93
71
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14
1.28
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2.6
26
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2.0
29
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12
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1
19
11
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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(0-2)
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18
32
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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3.0
21
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33
3
30
1.74
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2.4
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18
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3.0
21
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31
4
30
1.78
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11
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28
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13
1.13
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13
1.11
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1.9
33
84
12
85
55
6
25
12
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13447801--13448006
91
2.3
90
84
4
274
41
12
12
33
1.81
13447920--13447981
29
2.1
31
93
6
110
41
17
11
29
1.84
13448201--13448263
32
2.0
32
84
6
83
38
3
0
58
1.14
13448200--13448263
31
2.0
32
85
8
87
37
3
0
59
1.13
13449348--13449372
3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
13449725--13449770
22
2.1
22
92
4
76
41
0
6
52
1.27
13449722--13449770
21
2.2
23
85
10
75
42
0
6
51
1.27
13450114--13450155
20
2.1
20
100
0
84
28
4
0
66
1.12
13450354--13450520
92
1.8
90
83
7
221
34
10
22
32
1.89
13452177--13452223
24
1.9
24
82
4
58
46
4
10
38
1.58
13454435--13454571
31
4.5
31
69
9
111
44
15
10
29
1.79
13454383--13454614
91
2.5
91
84
4
254
43
15
9
30
1.80
13455751--13455796
17
2.7
17
81
18
60
21
17
6
54
1.65
13455679--13456326
358
1.8
357
81
3
809
23
19
11
45
1.82
13462208--13462629
213
2.0
213
93
0
729
35
17
9
37
1.83
13464625--13464658
17
2.1
16
88
5
50
58
17
8
14
1.61
13469137--13469246
55
2.0
55
98
0
211
36
12
6
44
1.68
13475496--13475556
27
2.3
26
80
2
68
40
21
9
27
1.85
13479097--13479138
12
3.6
11
90
9
66
80
7
2
9
0.97
13479491--13479528
19
2.0
19
100
0
76
26
10
15
47
1.78
13480178--13480219
10
3.7
12
81
18
54
69
2
16
11
1.29
13480262--13480339
12
6.4
12
70
18
54
62
0
23
14
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
13480285--13480318
15
2.3
15
89
0
50
67
0
29
2
1.05
13480272--13480324
18
2.8
20
68
26
53
64
0
24
11
1.26
13488633--13488669
9
4.1
9
85
0
56
45
10
10
32
1.74
13488881--13488940
30
2.0
31
86
3
86
20
38
0
41
1.52
13489588--13489613
5
5.2
5
100
0
52
23
19
19
38
1.93
13490211--13490388
25
7.1
25
79
6
164
33
19
19
28
1.96
13490211--13490388
75
2.4
75
83
3
207
33
19
19
28
1.96
13491944--13491984
21
2.0
21
85
9
57
36
4
4
53
1.44
13491944--13491985
22
2.0
21
81
13
50
38
4
4
52
1.44
13494771--13494841
20
3.5
20
68
0
61
14
29
21
35
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175