Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: NW_019167926.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_19, whole genome shotgun sequence Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 20060819

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   

This is table  47  of  117  ( 13965 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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118
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1.04
Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
A
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1.33
Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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Period
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Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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32
48
1.54
8853032--8853079
17
3.2
15
81
16
55
31
2
0
66
1.03
8854269--8854304
13
2.8
13
91
0
54
5
2
11
80
0.98
8854286--8854346
27
2.2
26
85
8
77
27
0
3
68
1.05
8854580--8854625
23
2.0
23
87
8
67
39
23
15
21
1.92
8854733--8854806
23
3.3
22
83
5
87
39
14
14
31
1.87
8854791--8854850
22
2.8
21
76
14
68
28
15
26
30
1.96
8854810--8855055
130
1.9
130
88
3
379
35
15
23
25
1.94
8855055--8855114
23
2.7
22
76
5
66
35
18
16
30
1.93
8855050--8855126
22
3.5
22
78
3
91
31
18
23
27
1.97
8855191--8855307
22
5.3
23
68
10
82
32
17
20
29
1.96
8854940--8855257
154
2.1
153
86
1
431
36
18
20
24
1.95
8855095--8855415
174
1.8
174
89
1
509
36
18
20
24
1.95
8855271--8855525
110
2.3
109
85
0
330
38
16
20
24
1.92
8855490--8855591
23
4.6
23
75
8
86
31
17
22
28
1.97
8854551--8855677
459
2.4
458
77
11
1171
36
17
20
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8855094--8855688
285
2.1
283
84
1
771
37
18
20
24
1.94
8855523--8855869
152
2.3
152
82
2
417
38
19
18
23
1.93
8855809--8855918
23
5.0
23
79
7
120
32
19
20
27
1.97
8855365--8856007
327
2.0
329
87
1
932
38
18
19
23
1.93
8855802--8855919
43
2.7
44
84
5
141
33
18
19
27
1.95
8855667--8856027
175
2.1
174
82
1
434
38
19
18
23
1.93
8856157--8856256
41
2.5
41
86
4
132
32
17
16
35
1.91
8856486--8856532
24
1.9
25
82
4
60
29
12
19
38
1.89
8857955--8857994
19
2.1
19
90
0
62
0
5
12
82
0.82
8864589--8864700
30
3.6
29
76
14
82
20
0
29
50
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117