Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23775123

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   

This is table  117  of  129  ( 15449 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
21002071--21002130
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0
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1.9
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83
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31
1
3
63
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0.98
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1.19
21022704--21022790
30
2.8
30
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102
28
4
1
65
1.19
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1.61
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1.05
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0
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2
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36
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3.4
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3
243
45
4
12
38
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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60
86
0
10
2
0.66
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2.2
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12
57
87
0
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2
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2.5
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100
0
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0
8
8
0.79
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18
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17
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3
0
45
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
233
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21
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4
17
36
1.68
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13
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28
1.94
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21
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36
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21109979--21110097
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42
3.2
41
82
6
153
22
11
18
46
1.81
21111025--21111175
42
3.7
42
80
7
150
22
12
19
45
1.83
21112349--21112389
12
3.5
12
84
15
59
21
0
7
70
1.11
21112408--21112785
197
1.9
193
83
6
476
49
6
8
35
1.61
21112988--21113122
56
2.4
55
84
6
173
50
8
11
29
1.68
21115878--21115938
26
2.3
26
88
5
88
34
13
0
52
1.40
21119947--21119986
20
2.0
20
90
9
64
42
2
10
45
1.51
21123779--21123814
18
1.9
19
88
5
56
16
5
2
75
1.12
21124639--21124680
12
3.5
12
90
9
68
21
0
7
71
1.09
21124701--21125055
195
1.8
194
84
10
492
48
6
9
35
1.61
21125084--21125184
47
2.1
47
85
1
139
55
6
11
25
1.61
21129155--21129201
22
2.2
21
82
17
53
46
4
12
36
1.62
21129193--21129335
63
2.3
63
85
2
180
34
10
23
30
1.89
21129201--21129377
63
2.8
63
79
5
144
34
10
24
30
1.89
21130204--21130342
42
3.4
42
82
6
160
24
10
19
45
1.82
21130212--21130362
41
3.7
41
80
7
146
22
13
19
45
1.85
21131529--21131586
11
5.4
11
76
13
50
17
0
6
75
1.01
21131544--21131585
12
3.5
12
84
12
59
23
0
4
71
1.05
21132185--21132321
55
2.4
55
82
8
159
48
8
12
29
1.71
21134873--21134919
18
2.7
18
83
3
60
53
0
2
44
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21134876--21134932
18
3.4
17
80
7
55
52
1
1
43
1.21
21138708--21138773
31
2.2
29
84
10
80
48
0
1
50
1.10
21138733--21138779
18
2.6
18
89
0
67
55
0
0
44
0.99
21140806--21140853
4
11.5
4
80
6
51
68
2
6
22
1.23
21153791--21153847
28
2.1
26
83
6
69
66
19
3
10
1.36
21159970--21160041
35
2.0
37
86
5
103
43
19
9
27
1.82
21160078--21160288
39
5.4
38
76
10
194
43
19
12
24
1.86
21160078--21160288
115
1.8
117
84
8
297
43
19
12
24
1.86
21160078--21160283
77
2.7
77
81
6
231
42
19
13
24
1.87
21171699--21171809
6
17.5
6
74
19
66
75
5
3
15
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129