Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23775123

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   

This is table  118  of  129  ( 15449 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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54
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42
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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20
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51
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41
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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12
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1.52
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0
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1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.1
30
86
11
87
57
1
4
35
1.29
21366834--21366876
21
2.0
21
81
0
50
62
2
0
34
1.08
21366955--21367015
23
2.7
22
75
7
59
57
4
1
36
1.30
21367462--21367499
15
2.7
14
84
11
51
65
0
0
34
0.93
21368130--21368155
6
4.3
6
100
0
52
0
15
0
84
0.62
21374543--21374573
4
7.8
4
100
0
62
25
0
22
51
1.48
21375256--21375300
3
15.7
3
81
9
58
66
4
0
28
1.11
21381596--21381639
12
3.5
12
85
14
54
18
0
6
75
1.02
21381715--21381779
32
2.0
34
90
6
107
55
4
3
36
1.36
21381781--21381993
59
3.7
58
79
9
231
50
6
9
33
1.61
21382554--21382589
16
2.2
16
90
0
54
47
0
0
52
1.00
21382718--21382779
16
3.9
16
78
0
79
53
6
1
38
1.37
21382883--21382954
30
2.4
30
83
2
92
38
5
8
47
1.57
21382996--21383070
30
2.5
29
78
6
87
49
5
5
40
1.48
21387287--21387345
27
2.2
27
87
6
84
28
1
23
45
1.63
21388121--21388176
28
2.0
29
82
3
69
30
14
21
33
1.93
21389288--21389358
32
2.3
31
82
4
81
23
5
25
45
1.75
21391446--21391513
31
2.2
31
82
10
77
48
1
1
48
1.19
21391446--21391536
32
2.9
30
79
11
76
50
1
1
47
1.15
21396806--21396835
8
3.8
8
95
0
51
50
6
0
43
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21399410--21399435
11
2.4
11
100
0
52
7
15
0
76
0.99
21414446--21414471
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
21425525--21425550
9
2.9
9
100
0
52
57
0
0
42
0.98
21438695--21438736
14
2.9
15
75
7
50
45
0
4
50
1.23
21454718--21454795
28
2.6
30
86
8
115
48
0
5
46
1.24
21455463--21455503
16
2.5
17
80
11
50
51
0
0
48
1.00
21455621--21455664
23
2.0
22
86
4
61
77
2
13
6
1.07
21460133--21460174
19
2.3
19
91
4
68
38
0
0
61
0.96
21461116--21461168
18
2.9
18
74
2
61
43
0
0
56
0.99
21461109--21461207
31
3.2
30
73
16
78
48
0
1
50
1.07

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129