Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23775123

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   

This is table  36  of  129  ( 15449 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
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(0-2)
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15
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1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Period
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Copy
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27
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Matches
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Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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35
1.60
7636433--7636530
42
2.4
40
83
8
117
48
6
9
35
1.60
7636513--7636546
16
2.1
16
88
0
50
58
5
5
29
1.45
7636433--7636560
10
12.9
10
68
14
50
49
5
7
38
1.53
7638273--7638308
3
11.7
3
94
5
63
66
0
0
33
0.92
7646782--7646837
21
2.7
21
85
0
76
37
5
5
51
1.47
7646796--7646918
63
1.9
64
81
1
149
37
8
8
45
1.65
7646794--7646918
21
5.9
20
75
6
79
36
8
8
46
1.64
7646798--7646918
42
2.9
42
77
3
118
37
8
9
45
1.66
7647275--7647466
22
8.7
22
71
14
119
38
10
7
43
1.68
7647476--7647917
22
20.0
22
70
10
186
38
8
4
47
1.54
7647555--7647625
11
6.5
10
71
15
52
30
5
2
60
1.34
7647642--7647724
43
1.9
44
85
2
114
40
6
4
48
1.49
7647708--7647831
46
2.7
47
72
14
114
35
9
6
48
1.62
7648213--7648354
22
6.5
22
73
14
71
35
6
7
51
1.55
7648213--7648384
44
4.0
43
75
5
148
34
6
8
50
1.60
7648291--7648385
22
4.4
22
73
6
68
33
6
11
48
1.65
7648500--7648539
19
2.1
19
95
0
71
42
7
0
50
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7648454--7648827
22
17.2
22
69
8
113
35
7
6
50
1.56
7648779--7648833
22
2.5
22
82
5
67
32
10
7
49
1.65
7649054--7649157
22
4.8
22
74
8
70
39
10
4
45
1.60
7649044--7649136
44
2.1
44
83
0
114
40
9
2
47
1.48
7649064--7649199
44
3.2
43
80
6
116
38
9
5
46
1.59
7651550--7651598
17
3.1
16
80
11
57
44
2
0
53
1.12
7651536--7651616
33
2.6
31
73
7
76
45
3
2
48
1.33
7661902--7661933
12
2.6
13
85
14
50
65
0
0
34
0.93
7662460--7662504
18
2.4
18
85
7
63
80
4
0
15
0.87
7662457--7662510
24
2.2
24
83
6
74
79
3
0
16
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129