Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23775123

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   

This is table  79  of  129  ( 15449 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
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22
86
0
61
43
2
4
50
1.35
14911953--14911986
18
1.9
18
88
5
52
44
0
2
52
1.16
14912155--14912209
12
4.5
13
84
8
71
58
1
0
40
1.09
14912155--14912246
12
7.8
12
72
17
68
53
2
1
43
1.20
14912152--14912198
6
7.7
6
81
11
51
57
0
0
42
0.98
14912155--14912209
18
2.9
19
82
15
78
58
1
0
40
1.09
14912153--14912209
25
2.3
25
82
11
73
59
1
0
38
1.08
14912155--14912225
37
1.9
36
83
8
90
54
2
0
42
1.14
14912434--14912529
21
4.5
21
72
22
67
42
2
0
55
1.11
14912471--14912529
15
3.9
15
72
18
59
40
1
0
57
1.09
14912453--14912529
24
3.2
24
80
12
88
42
1
0
55
1.07
14912730--14912794
14
4.7
13
75
17
51
47
3
3
46
1.33
14912768--14912800
15
2.1
16
88
5
50
48
6
0
45
1.27
14913092--14913139
24
2.0
24
84
8
62
41
0
2
56
1.11
14914677--14914720
16
2.7
16
78
3
52
54
2
0
43
1.12
14914848--14914872
13
1.9
13
100
0
50
40
8
0
52
1.31
14915120--14915152
13
2.5
14
85
14
52
51
6
0
42
1.26
14915109--14915149
21
2.0
20
85
4
55
51
7
0
41
1.30
14915238--14915273
18
1.9
19
88
5
56
55
2
2
38
1.29
14915981--14916023
22
2.0
21
86
4
59
55
2
2
39
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14918566--14918611
21
2.1
22
84
4
58
58
2
2
36
1.22
14919114--14919168
15
3.4
16
76
16
51
41
3
3
50
1.37
14919486--14919579
24
3.9
24
75
15
70
54
0
3
42
1.16
14919942--14920029
44
2.0
44
80
10
99
50
3
3
43
1.36
14920525--14920627
6
16.8
6
68
22
54
46
2
1
48
1.28
14920521--14920556
13
2.8
13
91
4
56
41
2
0
55
1.14
14920632--14920677
13
3.4
14
76
11
51
47
2
0
50
1.13
14920868--14920914
25
1.9
24
86
4
67
53
2
0
44
1.12
14920868--14920920
25
2.1
25
82
6
63
54
1
0
43
1.11
14921397--14921441
15
3.1
14
83
6
54
51
0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129