Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167838.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_11, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  23775123

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   

This is table  80  of  129  ( 15449 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
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Copy
Number
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Indels
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Period
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Score
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1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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(0-2)
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41
1.69
14947161--14947957
317
2.5
320
79
9
868
41
8
9
41
1.67
14947959--14948442
181
2.7
181
80
4
485
42
9
8
39
1.68
14948728--14948768
22
1.9
21
90
5
64
39
2
2
56
1.26
14948858--14948945
31
3.0
30
79
11
92
47
1
0
51
1.08
14949181--14949267
21
4.4
20
74
18
76
51
1
0
47
1.08
14949181--14949267
18
4.4
20
73
21
76
51
1
0
47
1.08
14949169--14949251
30
2.8
30
76
7
89
50
1
0
48
1.08
14949233--14949279
11
4.5
11
82
12
55
51
0
0
48
1.00
14949238--14949279
14
2.8
15
80
19
52
54
0
0
45
0.99
14949456--14949520
34
1.9
34
100
0
130
46
1
3
49
1.27
14949805--14949883
34
2.4
34
83
10
92
51
0
0
48
1.00
14949817--14949886
19
3.9
19
73
19
60
50
0
0
50
1.00
14950108--14950173
31
2.2
31
81
13
75
54
1
1
42
1.18
14950191--14950246
24
2.3
25
79
14
64
44
3
1
50
1.29
14950680--14950715
17
2.1
17
89
0
54
44
2
0
52
1.15
14950893--14950966
30
2.5
31
81
16
77
47
0
0
52
1.00
14951365--14951420
15
3.7
15
73
17
53
48
1
5
44
1.36
14951596--14951629
17
1.9
18
88
5
52
58
0
0
41
0.98
14952377--14952481
12
8.5
11
71
22
59
46
0
0
51
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14952379--14952492
39
3.1
37
82
13
112
44
0
0
53
1.12
14952377--14952500
12
10.2
12
69
18
51
46
0
1
50
1.16
14952635--14952677
22
2.0
22
86
9
61
53
6
0
39
1.28
14953097--14953139
16
2.7
16
85
0
50
53
0
2
44
1.13
14953168--14953197
15
2.0
15
93
0
51
56
0
3
40
1.16
14954075--14954101
14
1.9
14
100
0
54
44
0
0
55
0.99
14954071--14954144
24
3.0
24
70
18
62
45
1
0
52
1.09
14954634--14954685
21
2.4
23
81
12
65
46
1
0
51
1.12
14955123--14955176
19
2.8
20
77
8
58
46
1
3
48
1.30
14955267--14955312
19
2.4
19
100
0
92
43
0
0
56
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129