Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168481.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_8, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  25818110

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   

This is table  115  of  127  ( 15156 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
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Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
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Score
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Period
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Number
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Score
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
A
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1.79
21914855--21914892
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
21919303--21919352
22
2.3
22
82
6
57
46
0
2
52
1.12
21919324--21919368
22
2.0
22
83
8
56
46
2
0
51
1.13
21920954--21920978
13
1.9
13
100
0
50
48
4
0
48
1.20
21924132--21924172
13
3.1
14
74
25
52
63
0
0
36
0.95
21924129--21924187
20
3.1
19
79
11
59
62
1
0
35
1.05
21930035--21930071
18
2.1
18
85
14
51
72
2
0
24
0.97
21930639--21930676
2
19.0
2
100
0
76
50
0
0
50
1.00
21935163--21935212
22
2.3
22
82
6
57
46
0
2
52
1.12
21935184--21935228
22
2.0
22
83
8
56
46
2
0
51
1.13
21939999--21940032
6
5.7
6
85
0
50
67
0
0
32
0.91
21940006--21940053
16
3.0
16
81
6
53
64
0
0
35
0.94
21940000--21940053
12
4.8
12
76
15
53
64
0
0
35
0.94
21940002--21940064
28
2.3
28
86
2
83
63
0
0
36
0.95
21940026--21940063
20
2.0
20
89
5
60
63
0
0
36
0.95
21941263--21941330
31
2.2
31
82
7
77
52
4
7
35
1.49
21948338--21948363
2
13.0
2
100
0
52
0
50
0
50
1.00
21952512--21952536
13
1.9
13
100
0
50
64
4
0
32
1.12
21952490--21952584
30
3.1
29
78
15
86
57
1
1
40
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21952990--21953021
17
1.9
16
93
6
55
43
0
6
50
1.27
21953484--21953523
21
1.9
21
89
0
62
52
2
2
42
1.28
21953482--21953538
21
2.6
21
80
5
60
52
5
3
38
1.41
21953638--21953686
21
2.4
20
77
12
55
34
2
4
59
1.28
21953996--21954020
13
1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
21954627--21954665
18
2.2
18
95
0
69
48
0
2
48
1.15
21959688--21959720
3
11.0
3
100
0
66
33
66
0
0
0.92
21960030--21960126
49
1.9
51
91
4
162
29
5
9
55
1.53
21960208--21960311
25
4.0
26
74
17
81
63
1
0
34
1.06
21960232--21960308
6
12.5
6
72
18
52
66
1
0
32
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127