Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167827.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_10, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  24162007

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   

This is table  121  of  131  ( 15626 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.87
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1.9
21
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23
23
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.30
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Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Period
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Number
Consensus
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Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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22
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1.17
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86
13
54
58
0
0
41
0.98
21983770--21983813
22
2.0
22
90
0
70
38
11
6
43
1.67
21983995--21984024
15
2.0
15
93
0
51
60
0
30
10
1.30
21984207--21984244
18
2.0
20
85
10
53
31
7
7
52
1.59
21988716--21988758
22
2.0
22
86
9
61
34
6
9
48
1.62
21991102--21991126
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
21995423--21995476
27
2.0
27
92
0
90
33
3
9
53
1.50
21995448--21995579
21
6.2
21
71
14
83
35
6
9
48
1.61
21995527--21995585
22
2.7
22
73
21
61
38
5
8
47
1.56
21995590--21995629
21
1.9
21
85
10
55
37
7
5
50
1.53
21995743--21995774
14
2.4
14
94
5
57
40
3
0
56
1.15
21995990--21996038
22
2.2
22
88
0
71
38
8
6
46
1.58
21995998--21996116
22
5.4
22
76
7
64
39
5
6
47
1.54
21996182--21996278
44
2.2
44
81
3
115
43
11
3
42
1.56
21996208--21996280
22
3.3
21
73
7
65
43
8
4
43
1.53
21996260--21996346
22
4.0
22
67
12
54
34
10
4
50
1.57
21996392--21996541
22
6.8
22
72
13
112
38
6
3
52
1.42
21996406--21996590
22
8.3
23
70
17
106
38
5
3
51
1.44
21996413--21996604
11
17.2
11
66
16
56
38
5
3
52
1.43
21996416--21996625
22
9.5
22
68
17
89
36
6
3
52
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21996897--21996947
26
2.0
26
88
0
75
45
3
3
47
1.40
21996940--21997121
22
8.4
22
69
10
97
37
9
9
43
1.70
21996947--21997099
43
3.5
43
74
12
107
35
9
9
45
1.69
21997154--21997206
22
2.4
22
87
0
79
33
5
11
49
1.62
21997190--21997226
19
1.9
19
88
0
56
40
10
2
45
1.53
21997164--21997278
22
5.5
21
68
17
69
33
9
3
53
1.51
21997226--21997297
20
3.4
21
77
12
76
30
9
0
59
1.29
21997472--21997539
22
3.1
21
85
4
82
44
13
1
41
1.52
21997516--21997563
26
1.9
24
83
8
60
37
10
4
47
1.57
21997588--21997648
22
2.8
22
84
0
77
37
6
3
52
1.44

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131