Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167849.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_12, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  22966848

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   

This is table  125  of  129  ( 15374 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21733242--21733298
22
2.7
21
75
20
55
49
0
0
50
1.00
21733240--21733286
23
2.1
22
84
11
60
51
0
0
48
1.00
21747784--21747859
36
2.1
36
97
0
143
38
18
18
25
1.93
21755998--21756023
7
3.7
7
100
0
52
57
0
42
0
0.98
21756038--21756069
7
4.6
7
100
0
64
31
15
25
28
1.96
21756099--21756134
6
6.0
6
93
0
63
33
13
16
36
1.89
21760467--21760527
26
2.4
25
81
8
70
54
1
3
40
1.27
21760687--21760741
26
2.0
29
82
10
71
61
0
1
36
1.06
21760680--21760741
29
2.1
30
84
6
81
59
0
1
38
1.07
21763297--21763365
33
2.1
33
94
0
120
27
23
21
27
1.99
21764558--21764595
19
2.0
20
85
15
53
52
5
31
10
1.58
21765562--21765586
1
25.0
1
100
0
50
0
0
0
100
0.00
21773244--21773368
52
2.4
52
90
0
187
28
27
7
36
1.83
21773244--21773400
52
3.0
52
85
3
174
26
25
7
40
1.82
21773425--21773466
11
3.8
11
87
0
66
50
26
0
23
1.50
21786074--21786149
38
2.0
38
94
0
134
57
17
9
15
1.63
21786635--21786659
13
1.9
13
100
0
50
84
16
0
0
0.63
21787142--21787175
17
2.0
17
94
0
59
5
11
26
55
1.58
21791097--21791126
14
2.1
14
93
0
51
76
0
23
0
0.78
21794422--21794491
21
3.5
20
69
20
58
61
0
4
34
1.16
21796212--21796250
13
3.0
13
80
0
51
41
0
0
58
0.98
21797902--21797952
21
2.4
21
80
0
57
35
5
1
56
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21798080--21798148
30
2.3
30
77
2
77
52
5
5
36
1.50
21798364--21798478
54
2.1
54
82
6
135
31
4
4
60
1.36
21799445--21799489
20
2.2
20
92
0
72
68
2
0
28
1.01
21817415--21817445
11
2.7
12
90
10
55
41
0
0
58
0.98
21818233--21818262
2
14.5
2
93
6
51
46
3
0
50
1.18
21819262--21819314
23
2.3
23
83
0
61
32
1
5
60
1.31
21819650--21819686
12
3.0
13
84
7
51
67
0
0
32
0.91
21820453--21820490
4
9.5
4
100
0
76
73
0
0
26
0.83
21824761--21824817
13
4.2
13
77
4
60
3
7
5
84
0.87
21838046--21838075
2
15.5
2
93
6
53
50
0
0
50
1.00
21864007--21864083
33
2.3
33
80
8
84
45
9
3
41
1.54
21864988--21865038
18
2.9
17
78
21
61
35
0
3
60
1.15
21872633--21872658
2
13.0
2
100
0
52
50
0
0
50
1.00
21874318--21874642
112
2.9
112
85
1
411
31
18
13
36
1.90
21874585--21874742
80
2.0
80
96
0
289
39
17
16
27
1.90
21876668--21876717
18
2.8
18
80
14
59
64
2
2
32
1.16
21877485--21877537
26
2.2
23
75
18
61
56
0
1
41
1.10
21878025--21878069
20
2.2
20
100
0
90
46
0
0
53
1.00
21886238--21886280
21
2.0
21
100
0
86
32
9
30
27
1.88
21889863--21889923
15
4.1
15
83
8
79
65
13
21
0
1.26
21889873--21889941
12
5.2
12
80
15
59
65
15
18
0
1.28
21889863--21889932
30
2.4
29
83
9
90
64
15
20
0
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21892133--21892192
29
2.1
29
80
0
66
50
6
3
40
1.45
21892706--21892731
7
3.7
7
100
0
52
69
0
0
30
0.89
21892741--21892786
13
3.5
13
76
5
56
39
0
4
56
1.19
21892737--21892805
27
2.6
27
97
0
129
44
0
2
52
1.16
21892749--21892800
14
3.8
14
74
5
52
48
0
3
48
1.20
21892745--21892819
27
3.1
23
85
12
73
46
0
2
50
1.15
21893067--21893115
26
1.9
26
83
4
64
36
4
2
57
1.30
21899076--21899109
16
2.2
15
89
5
50
79
2
8
8
1.03
21901923--21901963
16
2.4
18
88
8
59
65
0
0
34
0.93
21901927--21901986
18
3.4
18
75
18
56
68
0
0
31
0.90
21901921--21901981
32
1.9
31
83
9
79
67
0
0
32
0.91
21902228--21902418
95
2.0
95
95
0
346
31
10
25
32
1.90
21902374--21902527
82
1.9
82
86
2
220
30
14
25
29
1.95
21911643--21911672
15
2.0
15
100
0
60
13
13
20
53
1.72
21914949--21914993
23
2.0
23
90
0
72
51
4
0
44
1.21
21915716--21915746
14
2.1
14
94
5
53
77
0
0
22
0.77
21915762--21915802
21
2.0
21
90
9
66
63
9
0
26
1.25
21918414--21918503
40
2.2
40
90
0
135
43
12
3
41
1.58
21918583--21918626
19
2.3
19
84
7
54
31
2
2
63
1.19
21922122--21922153
7
4.6
7
92
0
55
46
37
3
12
1.57
21928693--21928737
21
2.2
20
84
11
56
57
0
0
42
0.98
21928693--21928737
20
2.2
21
84
11
58
57
0
0
42
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21928687--21928739
22
2.4
21
75
12
54
58
1
0
39
1.09
21928777--21928844
32
2.2
32
89
7
104
55
8
0
35
1.31
21933299--21933337
20
2.0
20
89
0
60
51
2
0
46
1.14
21933462--21933490
14
2.0
15
93
6
51
62
0
0
37
0.96
21933562--21933614
22
2.5
20
81
6
61
56
1
0
41
1.10
21933932--21934012
29
2.7
30
76
18
80
53
1
0
45
1.08
21934167--21934205
18
2.2
18
85
0
51
28
0
5
66
1.12
21934277--21934319
16
2.6
16
85
7
59
32
0
0
67
0.91
21938328--21938423
32
3.1
33
65
23
91
46
6
7
39
1.57
21941119--21941170
26
2.0
27
96
3
97
42
0
3
53
1.19
21941693--21941731
20
1.9
21
84
5
53
30
7
0
61
1.24
21944327--21944360
17
1.9
18
88
5
52
29
11
5
52
1.61
21949174--21949209
2
18.0
2
88
0
54
50
5
0
44
1.25
21954134--21954307
86
2.0
85
92
1
285
28
12
18
41
1.86
21971625--21971827
101
2.0
101
91
0
325
22
19
16
41
1.90
21972661--21972916
128
2.0
128
100
0
512
31
12
22
33
1.91
21974317--21974357
22
1.9
22
85
5
57
53
0
0
46
1.00
21978874--21978916
19
2.1
21
87
12
63
46
0
2
51
1.13
21988387--21988704
58
5.3
57
77
12
252
35
10
8
46
1.68
21988401--21988682
62
4.7
58
83
9
318
35
11
7
46
1.67
21988401--21988673
58
4.6
58
81
10
286
35
11
7
45
1.69
21988707--21988787
5
15.4
5
74
16
67
79
2
4
13
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21988809--21988868
4
15.8
4
81
16
74
76
1
0
21
0.87
21988809--21988874
27
2.5
26
80
9
89
77
1
0
21
0.85
21989793--21989831
8
4.6
8
84
9
51
79
0
0
20
0.73
21989791--21989831
17
2.4
17
95
0
73
78
0
0
21
0.76
21989900--21989946
12
3.8
12
81
13
51
76
4
4
14
1.09
21991214--21991298
41
2.1
40
82
8
100
34
2
7
56
1.39
21995967--21996481
269
1.9
269
94
0
913
40
9
13
36
1.77
22016015--22016054
16
2.6
16
85
14
57
55
0
0
45
0.99
22016014--22016073
26
2.2
28
77
11
72
56
0
0
43
0.99
22016148--22016208
22
2.9
21
78
9
61
42
0
0
57
0.98
22018774--22018809
2
18.0
2
88
0
54
0
47
5
47
1.25
22029132--22029399
134
2.0
134
99
0
527
30
16
23
28
1.97
22034301--22034346
23
2.0
23
95
0
83
19
17
23
39
1.92
22041736--22041798
15
4.0
15
73
17
56
33
0
3
63
1.10
22041729--22041801
32
2.2
32
81
9
85
32
0
4
63
1.14
22045648--22045842
99
2.0
97
86
4
275
41
5
6
46
1.52
22060924--22060949
13
2.0
13
100
0
52
23
23
15
38
1.92
22078868--22078900
17
1.9
17
93
0
57
81
6
3
9
0.95
22083364--22083747
193
2.0
192
92
2
646
22
11
18
47
1.80
22089412--22089457
17
3.0
17
76
23
57
43
0
0
56
0.99
22089425--22089468
18
2.5
17
81
7
52
36
0
0
63
0.95
22093124--22093164
14
2.9
14
86
10
57
58
0
2
39
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22093131--22093174
16
2.9
16
86
6
56
56
0
2
40
1.11
22093137--22093196
22
2.8
23
79
16
60
58
0
3
38
1.15
22095177--22095222
24
1.9
24
86
0
65
52
2
2
43
1.25
22098618--22098656
20
1.9
21
84
5
53
20
7
15
56
1.63
22108066--22108119
23
2.2
26
87
9
78
38
5
0
55
1.23
22110044--22110228
91
2.0
91
96
0
343
40
14
9
35
1.79
22118720--22118747
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
22124647--22124684
2
19.0
2
94
0
67
47
0
0
52
1.00
22125941--22126000
26
2.3
28
81
18
76
45
0
1
53
1.10
22126000--22126061
20
3.0
21
78
17
58
50
0
0
50
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129