Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168381.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_6, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  26551601

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   

This is table  123  of  130  ( 15485 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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T
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(0-2)
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Period
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Copy
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Indels
Score
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Period
Size
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A
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24825579--24825656
29
2.6
30
84
8
97
44
0
3
51
1.19
24826378--24826412
4
8.8
4
100
0
70
22
0
0
77
0.78
24827357--24827413
16
3.4
17
78
7
62
19
0
5
75
0.99
24827368--24827449
13
6.2
13
71
10
51
15
4
3
75
1.11
24829654--24829705
24
2.2
24
96
0
95
46
15
5
32
1.70
24829654--24829711
24
2.4
24
91
0
80
46
13
6
32
1.70
24834711--24835022
157
2.0
157
82
0
381
34
11
20
33
1.88
24841904--24841955
27
1.9
27
88
7
79
38
5
3
51
1.44
24843281--24843310
15
1.9
16
93
6
53
83
0
10
6
0.81
24844248--24844289
10
4.0
10
82
17
50
66
0
0
33
0.92
24844248--24844292
22
2.0
22
83
8
56
66
0
0
33
0.92
24849966--24849990
3
8.3
3
100
0
50
0
0
68
32
0.90
24863534--24863561
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
24867179--24867506
163
2.0
163
99
0
647
38
26
14
20
1.91
24869696--24869744
26
1.9
26
87
4
73
46
0
6
46
1.27
24869798--24869832
16
2.2
16
89
0
52
31
2
0
65
1.07
24871262--24871299
11
3.7
10
86
13
51
57
2
0
39
1.12
24871712--24871746
2
17.5
2
100
0
70
0
51
0
48
1.00
24875664--24875700
12
3.1
12
92
0
56
48
5
0
45
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24876206--24876262
23
2.5
21
81
13
60
63
3
8
24
1.39
24879375--24879419
21
2.1
21
83
0
54
55
4
0
40
1.20
24881851--24881893
22
2.0
22
90
9
70
44
2
0
53
1.13
24881847--24881898
22
2.4
21
78
15
61
48
1
0
50
1.12
24881893--24881976
43
2.0
42
81
11
100
73
2
5
17
1.14
24885749--24885813
22
2.9
22
79
4
67
63
0
0
36
0.95
24895561--24895607
15
3.1
15
85
11
53
80
0
4
14
0.85
24896083--24896112
15
2.0
15
93
0
51
20
10
0
70
1.16
24908258--24908282
4
6.2
4
100
0
50
24
0
0
76
0.80
24908618--24908664
18
2.4
21
89
10
73
70
0
8
21
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130