Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168381.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_6, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  26551601

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   

This is table  35  of  130  ( 15485 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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19
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.57
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28
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2
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22
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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0
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19
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18
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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1.55
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1.51
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1.52
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19
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24
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1.54
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11
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11
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1.57
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17
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15
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2
0
53
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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1.13
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17
2.1
17
88
5
52
41
2
0
55
1.15
9018861--9018887
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3.9
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100
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0
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22
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0
0
62
0.95
9026043--9026119
23
3.1
23
72
24
75
37
0
2
59
1.11
9026056--9026145
30
3.0
29
83
3
108
36
0
4
58
1.18
9026065--9026146
29
2.8
30
85
7
114
39
0
4
56
1.21
9026128--9026174
17
2.7
17
83
3
67
48
0
2
48
1.13
9026167--9026251
29
3.0
29
77
6
77
63
1
3
31
1.19
9026190--9026257
28
2.4
29
78
7
77
64
1
1
32
1.11
9027645--9027695
21
2.3
23
90
10
88
45
3
1
49
1.32
9035030--9035054
12
2.1
12
100
0
50
28
8
16
48
1.74
9036886--9036956
28
2.5
28
90
0
106
45
22
18
14
1.85
9037289--9037401
28
4.3
28
68
14
87
31
15
14
38
1.87
9037338--9037524
50
3.8
50
72
12
141
37
13
13
35
1.84
9041414--9041589
74
2.4
73
80
0
199
42
15
12
29
1.84
9041734--9042030
60
4.9
60
78
3
245
48
9
15
26
1.76
9041749--9042089
121
2.8
117
77
7
301
48
9
16
25
1.77
9045426--9045742
115
2.8
112
78
8
343
39
11
6
42
1.67
9045425--9045773
58
6.1
58
82
6
347
38
12
6
43
1.66
9045490--9045775
115
2.5
114
82
7
337
40
11
5
43
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9045756--9045787
14
2.3
14
94
0
55
34
0
3
62
1.11
9045809--9045842
16
2.1
17
88
5
52
38
11
0
50
1.39
9045809--9045852
17
2.7
16
83
13
54
34
9
0
56
1.31
9045763--9045972
98
2.2
95
93
3
348
36
6
5
52
1.49
9046027--9046065
3
13.3
3
94
5
71
64
0
0
35
0.94
9046570--9046600
12
2.6
12
100
0
62
77
6
0
16
0.97
9046559--9046597
10
3.7
10
80
12
51
74
7
0
17
1.05
9046888--9046971
22
4.0
21
75
20
68
65
0
2
32
1.05
9046847--9046961
30
3.9
30
82
5
128
64
0
2
32
1.13
9046901--9046980
3
26.7
3
72
20
53
68
0
1
30
0.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130