Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr6 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 47432654

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  5  of  136  ( 16211 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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7.2
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27
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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1.94
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18
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7
193
41
22
16
19
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1435010--1435164
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2
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42
23
16
18
1.88
1435012--1435164
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1.9
81
87
4
229
42
22
16
18
1.89
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27
2.6
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4
30.8
4
98
0
237
50
23
0
26
1.50
1451642--1451851
91
2.3
91
85
0
269
29
19
20
30
1.97
1451716--1451959
90
2.7
90
81
5
244
32
19
16
30
1.94
1452687--1452729
20
2.2
20
87
8
61
67
4
0
27
1.10
1455399--1455472
27
2.8
25
82
11
94
35
12
9
43
1.74
1461140--1461195
21
2.7
21
78
15
62
37
5
17
39
1.73
1462222--1462250
15
1.9
15
100
0
58
41
6
17
34
1.76
1466848--1466876
15
1.9
15
100
0
58
41
6
17
34
1.76
1475933--1475968
18
1.9
18
88
5
54
58
2
0
38
1.13
1475961--1476006
22
2.1
22
84
8
58
50
0
0
50
1.00
1480399--1480480
42
2.0
42
92
0
137
47
13
18
20
1.82
1485939--1485978
15
2.7
15
88
0
62
25
5
12
57
1.55
1485972--1486088
9
14.1
9
66
26
55
21
2
19
56
1.54
1486090--1486159
33
2.1
33
89
0
104
25
4
17
52
1.62
1486110--1486184
33
2.3
34
79
11
84
21
4
21
53
1.62
1486255--1486279
13
1.9
13
100
0
50
32
4
16
48
1.64
1492800--1492876
31
2.7
27
75
14
82
20
3
23
51
1.63
1494021--1494077
29
2.0
29
82
6
71
52
7
12
28
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1495228--1495261
12
2.8
12
86
0
50
55
0
23
20
1.43
1502466--1502537
27
2.7
26
76
4
72
23
19
16
40
1.91
1502686--1503373
67
10.3
67
84
3
730
24
26
16
31
1.96
1516163--1516215
27
2.0
27
88
0
79
22
15
33
28
1.94
1526646--1526860
106
2.0
107
99
0
423
42
10
5
41
1.62
1529924--1530106
43
4.3
43
94
2
298
28
10
16
43
1.82
1530088--1530129
10
3.9
10
82
17
57
38
2
19
40
1.64
1530091--1530142
13
4.2
13
80
14
65
40
3
13
42
1.62
1530088--1530142
23
2.4
23
96
0
101
40
3
16
40
1.66
1531286--1531328
21
2.0
21
95
0
77
34
9
11
44
1.73

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136