Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168470.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_7, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  26282861

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   

This is table  109  of  133  ( 15876 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
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1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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21212057--21212092
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.75
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
0
2
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47
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126
28
11
3
57
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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43
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0
0
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84
0.62
21356619--21356657
17
2.2
17
86
4
51
0
0
15
84
0.62
21370445--21370488
22
2.0
23
87
12
67
54
0
2
43
1.12
21370514--21370570
21
2.7
21
86
8
71
68
0
7
24
1.14
21371443--21371550
42
2.5
42
78
15
123
37
16
13
31
1.88
21373290--21373335
10
4.4
10
81
8
56
10
10
0
78
0.97
21373289--21373335
21
2.2
21
85
7
60
12
10
0
76
1.02
21373290--21373336
11
4.4
11
76
13
53
10
10
0
78
0.96
21375500--21375551
21
2.5
21
90
3
79
25
28
25
21
1.99
21376486--21376781
140
2.1
137
83
4
380
50
12
11
26
1.73
21377442--21377528
45
2.0
44
84
6
113
59
10
6
22
1.54
21379770--21379804
9
4.0
9
96
3
63
0
34
8
57
1.29
21381738--21381776
20
2.0
20
85
9
55
30
7
12
48
1.69
21384076--21384112
3
12.0
3
94
5
65
67
0
0
32
0.91
21384067--21384112
16
2.9
16
93
3
76
65
0
2
32
1.05
21384620--21384646
12
2.2
12
100
0
54
0
0
11
88
0.50
21384617--21384645
14
2.0
15
93
6
51
0
0
10
89
0.48
21388846--21388878
16
2.1
16
88
11
50
51
3
0
45
1.16
21389769--21389958
86
2.2
86
81
3
213
35
3
15
44
1.65
21389983--21390040
26
2.2
26
78
6
64
37
6
18
36
1.78
21390371--21390481
55
2.0
55
85
0
150
34
2
15
47
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21394909--21394971
26
2.4
26
86
7
83
33
4
25
36
1.77
21394933--21395009
36
2.2
35
81
6
93
35
6
20
37
1.79
21396575--21396644
31
2.3
30
82
9
79
2
14
5
77
1.07
21396596--21396654
20
3.1
18
76
21
57
3
16
1
77
0.98
21401477--21401514
15
2.4
16
82
8
51
36
5
15
42
1.70
21401622--21401655
15
2.2
16
89
5
52
14
0
26
58
1.36
21402042--21402137
3
32.3
3
86
10
135
29
2
1
67
1.08
21408243--21408317
30
2.5
30
76
4
80
38
0
1
60
1.06
21408266--21408305
16
2.4
18
76
20
50
45
0
2
52
1.14
21408282--21408332
19
2.8
19
77
16
63
47
0
0
52
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133