Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168470.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_7, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  26282861

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   

This is table  4  of  133  ( 15876 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
788460--788501
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0
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0.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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612
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813924--813999
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2.0
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12
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1
27
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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46
1.10
966365--966422
21
2.5
25
83
13
79
55
1
0
43
1.10
966349--966428
33
2.5
32
75
15
83
61
1
0
37
1.04
969852--969877
2
13.0
2
100
0
52
50
0
50
0
1.00
971013--971053
3
13.7
3
100
0
82
68
0
0
31
0.90
972352--972376
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
977439--977480
21
2.0
20
86
4
57
52
0
0
47
1.00
985470--985513
13
3.3
13
87
3
61
31
0
9
59
1.29
990234--990266
17
1.9
17
100
0
66
48
9
6
36
1.60
990618--990643
5
5.2
5
100
0
52
19
42
0
38
1.51
993102--993154
17
3.3
17
69
15
58
54
0
5
39
1.24
993104--993171
31
2.2
32
97
2
129
51
0
5
42
1.26
993053--993154
48
2.1
48
81
3
125
50
1
9
38
1.47
993150--993227
24
3.5
24
66
20
69
55
1
7
35
1.37
993148--993241
42
2.2
42
86
0
134
57
1
7
34
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
993209--993252
11
3.8
11
85
11
61
68
0
2
29
1.02
993207--993246
13
3.2
13
86
13
50
67
0
2
30
1.04
995738--995781
23
1.9
23
85
0
61
59
6
2
31
1.36
999010--999048
20
2.1
18
85
9
51
53
0
0
46
1.00
1011175--1011215
4
10.2
4
94
0
64
0
29
0
70
0.87
1012351--1012389
6
6.5
6
100
0
78
30
17
35
15
1.91
1014332--1014381
20
2.6
19
84
12
66
34
0
0
66
0.92
1014332--1014390
20
3.0
19
76
11
57
38
0
0
61
0.96
1016541--1016627
18
4.8
18
66
16
63
36
3
2
57
1.28
1049216--1049240
13
1.9
13
100
0
50
28
32
8
32
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133