Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: NW_019168470.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_7, whole genome shotgun sequence Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 26282861

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   

This is table  128  of  133  ( 15876 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
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1.9
20
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23
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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18
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29
29
1.80
25141075--25141120
22
2.1
22
100
0
92
58
4
0
36
1.18
25141659--25141692
2
17.5
2
93
6
61
52
0
0
47
1.00
25144719--25144761
21
2.0
21
86
0
59
58
2
6
32
1.38
25146509--25146554
23
2.0
24
82
4
58
69
2
4
23
1.17
25147351--25147393
22
2.0
22
86
9
61
67
0
2
30
1.03
25147984--25148022
13
3.0
13
80
0
51
41
0
0
58
0.98
25148062--25148101
20
2.0
20
95
0
71
67
0
0
32
0.91
25149520--25149548
12
2.3
13
94
5
51
58
0
0
41
0.98
25150842--25150872
14
2.2
14
100
0
62
45
16
12
25
1.83
25151093--25151136
20
2.3
19
92
4
70
31
0
0
68
0.90
25151093--25151139
10
4.8
10
81
5
60
34
0
0
65
0.93
25151190--25151259
21
3.0
24
72
23
69
60
1
1
37
1.15
25151224--25151274
5
10.2
5
77
8
50
56
3
1
37
1.29
25160972--25161008
16
2.4
16
95
4
67
64
5
24
5
1.36
25162591--25162615
10
2.5
10
100
0
50
92
0
0
8
0.40
25164032--25164062
10
3.1
10
90
0
53
38
0
12
48
1.42
25165086--25165179
33
2.8
33
83
1
98
38
0
4
57
1.18
25165601--25165643
19
2.2
20
87
4
61
34
0
0
65
0.93
25165610--25165663
15
3.4
15
73
14
54
38
0
1
59
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25172433--25172470
13
2.8
14
80
8
51
26
5
0
68
1.11
25189071--25189118
21
2.3
21
77
0
51
37
0
6
56
1.25
25189182--25189224
22
1.9
22
85
4
59
41
0
2
55
1.12
25189206--25189235
10
3.0
10
90
0
51
53
0
0
46
1.00
25189337--25189371
13
2.7
13
86
0
52
48
5
0
45
1.26
25190256--25190291
18
2.0
18
89
10
56
52
5
0
41
1.24
25192819--25192910
4
23.2
4
79
6
98
19
2
27
51
1.59
25192999--25193110
4
27.8
4
87
1
134
20
3
27
48
1.66
25193001--25193157
12
13.0
12
84
1
125
14
2
33
49
1.57
25193114--25193170
2
28.5
2
89
0
87
3
1
45
49
1.29

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133