Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  46006518

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  76  of  141  ( 16825 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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36
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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21
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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1.61
25039063--25039254
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2
25
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
60
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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53
1.00
25172383--25172640
36
7.2
36
77
11
203
42
11
14
31
1.81
25172383--25172640
72
3.6
69
78
8
234
42
11
14
31
1.81
25172381--25172634
18
14.1
18
74
11
175
44
11
14
29
1.81
25172934--25172958
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
25173141--25173230
12
7.2
12
74
18
76
0
16
2
81
0.80
25173143--25173230
10
8.1
11
75
18
69
0
15
2
81
0.78
25173157--25173224
17
3.9
17
83
16
95
0
14
2
82
0.79
25173141--25173224
26
3.4
24
79
12
89
0
15
2
82
0.78
25173145--25173228
6
14.3
6
73
18
63
0
15
2
82
0.78
25173141--25173228
25
3.7
23
70
24
56
0
15
2
81
0.78
25173251--25173320
30
2.3
30
100
0
140
11
38
28
21
1.88
25173349--25173402
26
2.1
25
86
3
72
0
20
11
68
1.19
25173356--25173406
23
2.3
23
83
10
70
0
23
7
68
1.15
25173493--25173533
19
2.2
19
86
8
57
2
14
0
82
0.76
25173493--25173533
13
3.2
13
80
13
50
2
14
0
82
0.76
25173668--25173708
12
3.4
12
83
9
57
0
14
2
82
0.76
25173851--25173901
22
2.3
21
90
6
75
0
7
9
82
0.85
25173851--25173908
22
2.6
22
86
8
64
0
10
10
79
0.94
25174109--25174207
30
3.4
29
83
5
119
42
5
20
32
1.74
25174490--25175110
77
8.1
76
86
5
804
36
20
16
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25174490--25175110
153
4.0
152
87
4
811
36
20
16
26
1.94
25174398--25175110
230
3.1
228
84
6
851
36
20
16
27
1.94
25183366--25183667
35
8.5
35
78
11
242
44
11
15
28
1.82
25183367--25183667
18
16.9
17
77
10
262
44
11
15
27
1.82
25183960--25184006
16
2.9
16
78
12
51
59
0
2
38
1.09
25183945--25184010
21
3.1
21
82
6
80
60
0
1
37
1.06
25184157--25184223
9
7.0
9
77
15
64
0
17
1
80
0.79
25184157--25184209
18
2.9
18
84
15
74
0
15
1
83
0.74
25184411--25184501
47
2.0
46
87
10
132
1
28
0
70
0.95
25184589--25184639
12
4.4
12
79
13
54
0
23
0
76
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141