Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  46006518

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  87  of  141  ( 16825 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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Period
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Number
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Score
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Period
Size
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Number
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54
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Score
A
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(0-2)
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25
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18
27
20
33
1.96
28545353--28545397
22
2.0
22
86
0
63
60
2
0
37
1.09
28553930--28553989
30
2.0
31
86
3
86
50
1
21
26
1.59
28555853--28556094
43
5.4
44
84
9
312
28
19
22
29
1.98
28555853--28556095
87
2.7
92
91
7
415
29
18
22
29
1.98
28555915--28556119
87
2.4
86
92
4
288
30
19
21
28
1.97
28559232--28559349
62
2.0
61
85
8
161
50
3
5
41
1.41
28559328--28559377
20
2.7
19
80
20
61
52
2
2
44
1.24
28559334--28559381
25
1.9
25
83
8
62
52
2
2
43
1.24
28559291--28559440
68
2.1
71
80
8
164
52
3
4
40
1.39
28561846--28561983
45
3.1
44
88
2
179
32
21
23
21
1.98
28565955--28565980
3
8.7
3
100
0
52
65
34
0
0
0.93
28575704--28575847
25
5.9
25
68
8
82
33
22
26
18
1.96
28575877--28575951
26
3.0
26
72
18
77
37
24
24
14
1.93
28581321--28581351
15
2.1
15
100
0
62
25
25
29
19
1.99
28593725--28593756
17
1.9
16
93
6
55
0
9
0
90
0.45
28593729--28593755
11
2.5
11
100
0
54
0
7
0
92
0.38
28595214--28595256
18
2.3
19
80
8
52
34
2
0
62
1.08
28595922--28595992
21
3.4
21
66
0
61
28
0
25
46
1.53
28596042--28596133
34
2.7
34
83
8
116
41
0
16
42
1.48
28596207--28596662
126
3.6
126
90
2
672
38
17
16
28
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
28598222--28598273
17
2.9
17
80
11
50
57
15
9
17
1.64
28599026--28599082
3
19.0
3
80
7
62
57
1
5
35
1.31
28599036--28599105
18
3.7
20
76
19
62
60
0
5
34
1.21
28599140--28599164
12
2.1
12
100
0
50
68
16
16
0
1.22
28603030--28603102
26
2.7
27
71
16
69
50
4
0
45
1.20
28603164--28603208
21
2.1
21
95
0
81
4
20
42
33
1.72
28605472--28605507
18
2.0
18
94
0
63
38
8
27
25
1.84
28607171--28607229
30
2.0
30
89
0
91
45
3
22
28
1.68
28607171--28607256
30
2.9
29
81
8
84
41
3
20
33
1.70
28607858--28607907
17
2.8
17
79
8
55
18
18
2
62
1.43

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141