Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167949.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_21, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  19848060

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  40  of  138  ( 16447 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8846863--8846919
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1.69
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22
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35
0
4
60
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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2.0
129
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5.9
11
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7
1
20
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.20
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4
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2
2
24
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2.9
15
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13
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2
2
23
1.08
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21
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3.4
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22
13
21
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1
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1
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1.01
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0
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0
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2.9
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5
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1.90
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2.5
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311
40
18
15
26
1.90
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44
4.8
42
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3
130
39
18
15
26
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8919506--8919610
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2.5
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17
15
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1.89
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20
2.0
20
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33
12
7
46
1.71
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10
11
0
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11
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1
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30
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37
13
5
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1.68
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11
5
44
1.64
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2.4
17
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2
0
16
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11
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16
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0
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0
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11
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0
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2
3
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13
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20
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1
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4.8
12
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10
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70
6
0
22
1.10
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24
2.8
24
80
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68
69
7
1
21
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.5
44
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1
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14
22
43
1.87
8955698--8955948
87
2.9
87
89
0
367
20
13
22
43
1.87
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25.7
3
73
15
50
24
2
1
72
1.06
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15
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19
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22
2
1
74
0.99
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13
7.4
12
72
15
64
22
2
2
73
1.05
8958783--8958829
3
15.7
3
100
0
94
65
0
0
34
0.93
8962728--8963163
144
3.0
144
98
0
845
25
23
11
39
1.88
8964569--8964798
57
4.0
57
86
5
291
36
13
6
43
1.69
8964682--8964773
27
3.2
27
64
28
64
35
15
6
42
1.73
8965994--8966027
11
3.1
11
95
0
59
20
26
14
38
1.91
8966873--8966909
16
2.3
16
90
0
56
0
5
8
86
0.70
8966947--8967189
44
5.5
44
81
4
269
41
17
15
25
1.89
8967125--8967278
41
3.7
41
77
10
136
41
13
16
28
1.86
8968962--8969090
16
7.9
16
80
11
120
6
12
0
79
0.96
8968949--8969094
50
2.9
50
81
6
197
7
13
0
78
0.98
8969000--8969048
1
49.0
1
79
0
53
4
6
0
89
0.57
8968986--8969093
41
2.8
39
76
15
93
7
11
0
80
0.94
8968962--8969093
8
17.2
8
77
16
104
7
12
0
79
0.97
8973014--8973053
11
3.7
11
93
3
64
82
0
12
5
0.82
8973074--8973426
59
6.0
59
86
3
471
39
11
5
44
1.62
8973108--8973426
117
2.7
112
84
8
377
39
10
4
45
1.59
8975263--8975296
17
1.9
18
94
5
61
82
2
0
14
0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8975732--8975776
2
24.0
2
82
13
60
46
2
0
51
1.13
8975732--8975776
9
4.9
9
91
2
72
46
2
0
51
1.13
8986535--8986592
25
2.4
25
80
5
66
43
17
24
15
1.87
8988060--8988098
20
2.0
20
100
0
78
23
0
30
46
1.53
8992023--8992056
13
2.8
12
82
8
50
47
0
0
52
1.00
8992125--8992188
32
2.0
32
82
11
78
43
9
7
39
1.66
8992301--8992344
9
4.7
10
86
13
51
27
0
6
65
1.17
8992306--8992361
16
3.4
16
82
9
60
32
0
3
64
1.11
8992863--8992919
25
2.3
24
79
8
69
42
5
17
35
1.72
8993164--8993199
18
2.0
18
88
0
54
41
8
36
13
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138