Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167949.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_21, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  19848060

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  38  of  138  ( 16447 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8621787--8621870
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29
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1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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3
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1.03
8639627--8639705
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3.4
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2016
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
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(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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78
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13
71
21
54
70
1
6
21
1.18
8707558--8707667
23
4.7
22
73
15
80
70
0
6
21
1.15
8707558--8707637
24
3.4
23
79
17
85
70
1
7
21
1.19
8707610--8707673
25
2.5
25
78
14
69
71
1
3
23
1.08
8707886--8707925
14
2.9
14
85
10
55
67
2
0
30
1.04
8708107--8708159
18
3.2
16
75
15
54
37
0
1
60
1.08
8708121--8708162
22
2.0
20
86
9
57
35
0
2
61
1.09
8709685--8709735
18
2.8
17
77
11
57
13
15
1
68
1.30
8709874--8709939
6
10.8
6
77
9
62
4
18
1
75
1.04
8709876--8709928
19
2.8
19
83
10
65
3
18
1
75
1.05
8710479--8710519
19
2.3
19
87
8
59
46
0
0
53
1.00
8712148--8712216
18
3.9
18
73
16
63
13
4
2
79
0.99
8712171--8712216
23
2.0
23
91
0
74
13
0
4
82
0.81
8714707--8714885
3
61.3
3
77
12
151
31
2
5
60
1.32
8714851--8714882
16
2.0
16
93
0
55
21
0
3
75
0.95
8717374--8717460
24
3.6
23
73
14
77
40
6
10
42
1.66
8717356--8717481
50
2.5
50
88
0
198
40
7
11
41
1.68
8720754--8720812
17
3.4
17
76
4
55
15
8
3
72
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8720753--8720794
18
2.3
19
80
12
52
14
7
0
78
0.95
8720765--8720849
35
2.3
36
84
9
102
20
7
3
69
1.27
8723276--8723501
60
3.8
59
85
6
298
49
3
11
34
1.58
8723276--8723501
58
3.8
57
84
8
276
49
3
11
34
1.58
8726748--8726973
59
3.9
57
79
11
237
47
5
11
35
1.62
8726752--8727090
59
5.9
57
74
13
225
46
6
12
35
1.67
8726883--8726974
27
3.2
27
63
24
62
45
5
13
35
1.66
8726761--8727000
118
2.1
116
83
8
301
48
5
11
35
1.62
8728202--8728243
17
2.5
17
88
0
66
23
21
7
47
1.75
8731106--8731207
10
10.8
9
76
16
91
75
0
14
8
1.09

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138