Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019167949.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_21, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  19848060

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  36  of  138  ( 16447 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Copy
Number
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Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
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Size
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Percent
Indels
Score
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Period
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1.97
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Period
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Copy
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Score
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Period
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Copy
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11.9
14
67
11
82
53
26
1
19
1.52
8471162--8471245
29
2.9
29
94
1
143
50
30
1
17
1.54
8475251--8475290
20
1.9
21
85
10
55
47
0
0
52
1.00
8477071--8477129
20
3.0
20
84
0
73
52
3
1
42
1.28
8482117--8482172
28
2.0
28
92
0
94
23
10
17
48
1.79
8483796--8483915
16
7.7
16
76
11
79
21
1
27
49
1.59
8483795--8483914
30
3.9
30
76
15
102
20
1
28
49
1.59
8483872--8483926
16
3.4
16
77
7
58
29
1
18
50
1.57
8484337--8484377
14
2.7
16
77
14
50
70
0
2
26
0.99
8485266--8485304
20
2.0
20
84
0
51
7
23
0
69
1.14
8485574--8485920
110
3.2
108
85
2
399
36
19
21
23
1.95
8485822--8485993
88
2.0
87
89
3
265
38
16
23
22
1.93
8485701--8486117
197
2.1
198
84
3
545
37
17
21
22
1.94
8486095--8486146
22
2.3
23
83
12
72
38
23
15
23
1.92
8485653--8486213
307
1.8
308
87
1
838
38
18
21
22
1.94
8485900--8486328
220
2.0
219
85
2
583
40
18
19
21
1.92
8485899--8486333
110
4.0
110
83
2
507
40
17
19
21
1.91
8486374--8486434
23
2.7
23
89
0
95
27
22
24
24
2.00
8488162--8488198
15
2.4
16
95
4
67
8
8
0
83
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8488615--8488652
10
3.9
10
89
3
51
10
5
0
84
0.77
8493936--8494089
16
10.5
15
71
17
110
16
0
35
47
1.51
8493995--8494102
30
3.5
31
85
3
146
16
1
34
47
1.58
8493995--8494093
16
6.4
15
81
10
119
15
1
36
47
1.52
8494020--8494111
32
2.9
31
78
12
73
18
2
32
46
1.61
8494458--8494488
16
1.9
16
93
0
53
19
0
35
45
1.51
8494445--8494551
51
2.1
50
83
10
128
14
0
35
49
1.44
8494498--8494605
16
7.2
15
77
14
107
17
0
33
49
1.47
8494498--8494604
30
3.6
30
83
7
130
17
0
33
48
1.48
8496017--8496049
3
11.0
3
100
0
66
33
0
0
66
0.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138