Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168270.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  27802247

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   

This is table  128  of  147  ( 17591 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Indels
Score
A
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Period
Size
Copy
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Score
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Period
Size
Copy
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(0-2)
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11
51
6
10
0
82
0.82
23186998--23187049
4
13.2
4
81
4
52
55
1
17
25
1.52
23187007--23187046
20
2.0
20
95
0
71
60
2
15
22
1.47
23188789--23188813
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
23189375--23189404
7
4.3
7
100
0
60
60
0
0
40
0.97
23189693--23189737
20
2.3
20
88
11
67
71
0
2
26
0.98
23189691--23189738
19
2.3
22
76
23
59
72
0
2
25
0.95
23189692--23189752
21
3.0
20
79
11
70
63
1
3
31
1.20
23190695--23190721
13
2.1
13
100
0
54
14
7
22
55
1.64
23191474--23191498
2
12.5
2
100
0
50
52
0
0
48
1.00
23193128--23193190
31
2.0
31
87
6
92
22
19
9
49
1.76
23199304--23199333
10
3.1
10
95
4
53
36
0
0
63
0.95
23199306--23199335
9
3.2
9
95
4
51
36
0
0
63
0.95
23199980--23200038
29
2.1
29
84
12
79
50
15
10
23
1.74
23202785--23202831
18
2.5
19
80
16
53
36
2
0
61
1.08
23205320--23205422
53
2.0
52
84
5
136
48
0
18
32
1.55
23209239--23209335
5
19.8
5
72
24
59
75
1
1
22
0.93
23209236--23209354
13
9.4
13
73
14
88
77
1
2
18
0.97
23209276--23209347
17
4.2
16
77
15
65
80
2
2
13
0.93
23209290--23209347
30
1.9
30
86
6
82
81
1
3
13
0.91
23209236--23209347
8
13.9
8
73
5
66
76
1
1
19
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23209737--23209795
9
6.1
9
85
14
82
42
13
0
44
1.44
23209724--23209795
10
7.2
10
79
4
83
44
12
1
41
1.51
23209726--23209795
20
3.5
20
92
3
106
44
11
1
42
1.49
23217557--23217624
33
2.1
33
100
0
136
41
17
8
32
1.80
23219357--23219382
8
3.2
8
100
0
52
38
11
23
26
1.89
23223383--23223432
23
2.2
23
82
13
59
78
4
2
16
1.00
23223378--23223424
19
2.4
20
79
13
53
76
6
2
14
1.08
23223782--23223824
20
2.3
19
84
8
52
48
6
13
30
1.69
23223782--23223825
19
2.2
20
84
4
54
50
6
13
29
1.68
23224675--23224868
41
4.7
41
76
5
158
42
14
17
25
1.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147