Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168270.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  27802247

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   

This is table  135  of  147  ( 17591 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
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Indels
Score
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Period
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Number
Consensus
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Score
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1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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Period
Size
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Score
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1.05
24638241--24638272
16
1.9
17
93
6
57
43
0
0
56
0.99
24638273--24638311
19
2.1
19
90
0
60
53
2
0
43
1.14
24639674--24639715
16
2.6
16
84
3
57
52
0
0
47
1.00
24639669--24639716
25
1.9
25
83
8
62
56
0
0
43
0.99
24642671--24642962
146
2.0
146
93
0
494
34
14
15
35
1.88
24645518--24645548
2
15.5
2
100
0
62
48
0
0
51
1.00
24646696--24646744
18
2.8
17
79
11
55
46
0
0
53
1.00
24647165--24647231
30
2.2
30
86
0
89
46
4
2
46
1.38
24647694--24647757
24
2.6
26
78
9
71
54
1
0
43
1.09
24647694--24647784
25
3.6
25
75
20
75
51
1
0
47
1.07
24648201--24648250
25
2.0
25
96
0
91
42
12
2
44
1.53
24649370--24649401
16
2.0
16
93
0
55
65
0
0
34
0.93
24656168--24656198
16
1.9
16
93
0
53
35
19
32
12
1.90
24664754--24664783
2
15.5
2
93
6
53
46
0
0
53
1.00
24667912--24668028
38
3.3
38
65
26
110
47
5
5
41
1.53
24667896--24668037
68
2.1
68
98
1
277
45
5
7
42
1.55
24668324--24668417
29
3.0
31
81
9
95
52
2
7
38
1.42
24674376--24674440
22
2.7
24
77
18
64
52
0
1
46
1.10
24674514--24674570
22
2.5
22
91
2
87
42
5
5
47
1.48
24676459--24676483
5
5.0
5
100
0
50
80
0
0
20
0.72
24676901--24676951
15
3.3
15
73
10
50
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24676923--24676968
21
2.0
25
84
16
64
34
2
2
60
1.21
24677519--24677557
20
1.9
20
89
5
60
28
0
2
69
1.02
24677496--24677559
23
2.9
23
80
13
64
31
0
3
65
1.08
24678932--24678994
6
10.3
6
76
10
65
47
3
1
47
1.27
24683093--24683153
13
4.5
13
73
16
52
39
1
1
57
1.18
24683160--24683190
16
1.9
16
93
0
53
64
0
0
35
0.94
24683568--24683615
15
3.1
15
79
11
53
68
0
2
29
1.01
24683724--24683765
22
1.9
22
100
0
84
47
0
0
52
1.00
24684384--24684441
6
9.2
6
85
10
80
65
0
0
34
0.93
24684490--24684528
13
2.9
13
88
7
60
51
0
2
46
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147