Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168270.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  27802247

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   

This is table  146  of  147  ( 17591 repeats found )

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Table Explanation

Indices
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Period
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Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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70
6
5
17
1.27
27716566--27716625
13
4.5
13
76
16
61
76
1
1
20
0.96
27716556--27716623
27
2.4
28
78
14
68
76
1
1
20
0.94
27716577--27716639
33
2.0
31
87
12
92
77
3
3
15
1.02
27716528--27716628
6
16.0
6
72
19
57
76
0
3
18
1.00
27716835--27716938
43
2.4
43
82
6
129
38
22
16
23
1.93
27716915--27717091
41
4.3
41
87
2
275
33
22
17
25
1.96
27718095--27718146
10
5.2
10
80
17
54
13
13
0
73
1.11
27718101--27718135
18
1.9
18
100
0
70
14
11
0
74
1.08
27718101--27718136
8
4.2
8
86
13
54
13
11
0
75
1.06
27723515--27723573
20
3.0
20
94
0
100
18
30
28
22
1.97
27723610--27723650
7
6.1
7
86
13
52
14
0
0
85
0.60
27723613--27723647
6
5.8
6
90
10
54
14
0
0
85
0.59
27723876--27723908
12
2.9
12
86
13
52
21
0
0
78
0.75
27724223--27724293
31
2.3
31
85
4
99
21
23
25
29
1.99
27724357--27724401
19
2.4
19
88
0
63
22
31
22
24
1.99
27724727--27725166
152
2.9
153
95
1
796
30
15
18
36
1.91
27728395--27728419
1
25.0
1
100
0
50
100
0
0
0
0.00
27728821--27728880
16
3.6
16
74
12
57
78
0
15
6
0.95
27728850--27728888
8
4.9
8
93
0
69
74
0
15
10
1.07
27730083--27730547
83
5.7
83
92
3
728
23
17
22
36
1.95
27730077--27730547
41
11.5
41
90
3
657
23
17
22
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27730693--27730751
20
3.0
20
94
0
100
18
30
28
22
1.97
27730788--27730820
13
2.5
13
95
5
57
15
0
0
84
0.61
27730788--27730820
7
4.9
7
92
7
59
15
0
0
84
0.61
27730788--27730828
13
3.1
13
85
3
55
14
0
0
85
0.60
27731053--27731085
12
2.9
12
86
13
52
21
0
0
78
0.75
27731400--27731466
31
2.2
31
86
5
91
20
22
23
32
1.98
27731534--27731576
19
2.3
19
87
0
59
23
30
20
25
1.99
27731905--27732355
152
3.0
152
95
1
805
29
14
17
37
1.90
27734511--27734542
15
2.1
16
94
5
57
56
6
18
18
1.62
27737682--27738117
59
7.5
58
84
6
557
34
13
8
43
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147