Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_D09 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 51526817

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  172  ( 20605 repeats found )
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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2450379--2450455
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3.7
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2.0
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2.0
138
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2
348
29
21
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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23
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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20
14
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2.1
82
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20
14
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1.92
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10
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46
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21
21
26
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5.1
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0
63
30
2
27
38
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2734577--2734671
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4.2
23
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2
165
32
25
21
21
1.98
2734581--2734670
45
2.0
45
95
0
162
33
26
21
18
1.96
2734897--2734935
18
2.2
17
86
13
53
46
20
0
33
1.51
2736588--2736614
13
2.1
13
100
0
54
22
0
14
62
1.31
2737865--2737980
61
2.0
61
88
8
177
42
4
5
48
1.45
2737867--2737985
58
2.0
60
84
10
158
43
4
5
47
1.44
2741050--2741088
21
1.9
20
89
5
60
17
5
33
43
1.72
2741615--2741698
42
2.0
42
95
0
150
50
13
1
35
1.49
2743753--2743793
21
1.9
22
90
5
66
17
31
21
29
1.96
2744037--2744081
22
2.0
23
87
8
67
13
17
6
62
1.52
2745944--2745976
9
3.7
9
91
0
57
45
0
3
51
1.16
2749110--2749151
16
2.5
17
82
14
52
30
2
0
66
1.04
2752922--2753001
32
2.5
33
82
10
103
18
20
20
41
1.91
2758688--2759109
116
3.7
115
78
4
383
31
18
17
32
1.94
2771192--2771230
17
2.2
19
86
9
55
64
2
2
30
1.21
2774657--2774743
44
2.0
44
97
0
165
29
12
11
45
1.77
2778489--2778517
14
2.1
14
100
0
58
51
6
13
27
1.66
2792836--2793043
91
2.3
91
91
0
326
45
2
3
48
1.35
2792836--2792974
47
3.0
44
68
18
122
45
2
5
46
1.39
2792947--2793018
26
2.6
28
84
8
85
41
0
4
54
1.20
2792868--2793011
47
3.1
47
69
16
138
43
1
4
51
1.29
2792876--2793018
44
3.2
43
68
16
119
44
1
3
50
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2793059--2793351
120
2.4
120
92
3
475
42
2
4
50
1.38
2793184--2793235
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
2793313--2793362
15
3.3
16
78
18
54
48
0
2
50
1.12
2793304--2793345
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
2795343--2795435
41
2.3
41
98
0
177
21
17
24
36
1.94
2797244--2797282
17
2.3
17
100
0
78
5
10
33
51
1.58
2798950--2799008
23
2.5
24
83
5
68
49
27
15
8
1.73
2802905--2802944
16
2.5
16
95
0
71
37
7
27
27
1.84
2803085--2803206
55
2.2
55
82
7
140
50
4
0
44
1.26
2803591--2803657
35
1.9
35
100
0
134
28
5
20
44
1.75

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172