Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_D13 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 60343961

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  83  of  204  ( 24404 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25399774--25399843
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26
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95
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1.93
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2.0
217
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1.9
19
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29
2
2
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1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
26
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100
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2.5
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164
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3
39
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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2.0
211
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14
24
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25608647--25608742
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13
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25
40
1.90
25692419--25692465
20
2.3
20
92
0
76
53
0
21
25
1.46
25694169--25694224
24
2.3
24
87
0
76
46
14
17
21
1.84
25695495--25695539
22
2.0
23
83
16
58
53
6
17
22
1.67
25698020--25698062
22
2.0
22
86
4
61
51
13
4
30
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25698055--25698098
23
2.0
23
86
8
65
54
4
4
36
1.41
25700624--25700663
21
1.9
21
89
0
62
42
12
10
35
1.76
25705695--25705755
31
2.0
30
90
3
95
40
13
24
21
1.88
25705736--25705796
28
2.2
28
85
5
79
40
22
26
9
1.85
25711135--25711172
18
2.1
18
95
0
67
42
23
10
23
1.85
25713668--25713725
18
3.1
18
73
23
57
43
5
31
20
1.74
25713650--25713725
39
2.0
38
84
7
100
40
6
30
22
1.79
25715547--25715832
142
2.0
143
98
0
556
42
11
6
39
1.68
25721379--25721657
50
5.5
50
86
4
346
26
21
29
22
1.99
25721941--25721979
20
2.0
20
89
0
60
53
2
25
17
1.56
25724380--25724416
19
1.9
19
94
0
65
24
21
0
54
1.45
25724384--25724426
19
2.2
20
80
12
54
30
18
0
51
1.47
25724555--25724729
51
3.5
50
75
10
160
30
28
17
23
1.97
25728749--25728801
24
2.2
25
83
10
65
52
0
3
43
1.19
25729366--25729410
14
3.1
14
81
12
56
48
0
2
48
1.13
25729361--25729408
23
2.0
24
88
11
73
47
0
4
47
1.21
25729472--25729531
30
2.0
30
83
6
77
46
11
10
31
1.73
25737563--25737596
17
2.0
17
94
0
59
20
11
8
58
1.59
25738502--25738542
22
1.9
22
85
5
57
31
9
9
48
1.69
25749353--25749711
41
8.6
40
80
9
387
35
26
16
22
1.95
25749349--25749670
84
3.8
84
95
0
572
35
26
16
21
1.94
25753036--25753063
14
2.0
14
100
0
56
64
0
7
28
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25756899--25757073
27
6.4
27
82
6
192
26
14
28
30
1.95
25756900--25757055
82
1.9
81
87
6
226
26
15
28
29
1.96
25756896--25757073
82
2.2
81
81
5
216
26
15
27
30
1.96
25765055--25765231
27
6.5
27
82
6
196
26
15
28
29
1.96
25765056--25765211
82
1.9
81
87
6
226
26
15
28
29
1.96
25765052--25765231
82
2.2
81
82
4
220
26
15
27
30
1.96
25768987--25769013
6
4.5
6
100
0
54
18
0
0
81
0.69
25771749--25771792
14
3.1
14
78
12
54
25
9
0
65
1.21
25772664--25772727
21
3.0
21
80
13
69
17
4
6
71
1.24
25772668--25772722
24
2.2
25
87
3
76
18
3
5
72
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204