Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  60343961

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   

This is table  204  of  204  ( 24404 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60216848--60217051
103
2.0
103
93
1
347
33
28
19
18
1.95
60216711--60217050
179
1.9
179
86
3
488
31
29
20
17
1.96
60217385--60217442
30
1.9
30
85
0
80
31
24
6
37
1.82
60220128--60220204
38
2.0
38
97
0
145
33
5
32
28
1.79
60251505--60251558
19
2.9
18
81
8
63
53
3
1
40
1.29
60253009--60253075
33
2.0
34
85
2
91
49
1
0
49
1.10
60255282--60255348
33
2.0
32
82
11
80
52
0
0
47
1.00
60257080--60257147
33
2.0
34
85
2
93
52
1
0
45
1.09
60258107--60258158
26
2.0
26
100
0
104
34
3
30
30
1.76
60258791--60258858
33
2.0
33
85
2
91
52
0
0
47
1.00
60264603--60264632
13
2.3
13
94
0
51
20
0
40
40
1.52
60266892--60266916
2
12.5
2
100
0
50
52
0
48
0
1.00
60267487--60267543
27
2.1
27
96
0
105
35
14
22
28
1.93
60268758--60268793
16
2.3
15
95
4
63
55
0
38
5
1.23
60271119--60271143
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
60275426--60275476
26
2.0
26
96
0
93
35
13
15
35
1.87
60275844--60275924
25
3.2
25
75
13
85
28
18
29
23
1.98
60275836--60275938
50
2.0
51
81
5
120
30
19
28
22
1.98
60275953--60276015
27
2.5
26
82
7
76
39
19
19
22
1.92
60277134--60277163
13
2.3
13
94
0
51
40
40
0
20
1.52
60277305--60277381
9
8.4
9
80
8
75
25
10
23
40
1.86
60288286--60288354
16
4.2
16
92
3
120
24
1
37
36
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
60288286--60288354
33
2.1
32
94
2
120
24
1
37
36
1.65
60288335--60288425
45
2.0
45
85
2
121
27
6
28
37
1.82
60288573--60289040
120
3.9
120
98
0
893
47
6
2
43
1.41
60297594--60297655
13
4.8
13
75
0
61
37
22
4
35
1.76
60297594--60297655
26
2.4
26
78
5
72
37
22
4
35
1.76
60298684--60298721
18
2.1
18
85
9
51
47
13
5
34
1.65
60301377--60301409
3
11.0
3
100
0
66
66
0
0
33
0.92
60307995--60308023
15
1.9
15
100
0
58
58
0
6
34
1.25
60311112--60311223
60
1.9
58
85
3
152
41
8
7
43
1.61
60312464--60312504
22
2.0
21
86
13
59
58
17
4
19
1.56
60316586--60317114
120
4.4
120
93
2
877
43
0
4
51
1.28
60316702--60316855
18
8.9
18
66
18
76
42
0
2
54
1.19
60316586--60317100
237
2.2
237
92
1
852
43
0
4
51
1.27
60317058--60317092
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
60317328--60317379
16
3.2
16
91
0
77
34
34
0
30
1.58
60317756--60317782
8
3.4
8
100
0
54
62
0
0
37
0.95
60321940--60322147
91
2.3
91
83
5
251
33
5
11
50
1.60
60322963--60323109
78
1.9
78
91
0
240
27
25
22
25
2.00
60335311--60335351
21
2.0
21
85
9
57
12
14
26
46
1.80
60339569--60339607
20
2.0
20
85
14
55
61
0
2
35
1.10
60342890--60342918
15
1.9
15
100
0
58
44
6
0
48
1.29
60342380--60343330
516
1.8
518
93
1
1640
29
17
17
36
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204

The End!