Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: CP032252.1 Gossypioides kirkii chromosome KI_10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  47257441

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   

This is table  79  of  163  ( 19493 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21167621--21167700
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5
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50
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1.20
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0
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2.5
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2
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1.26
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2.3
28
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2
2
25
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.18
21194817--21194894
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2.1
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2.0
408
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11
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21311388--21311441
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20
11
11
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2.4
26
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12
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.6
17
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17
11
11
60
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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11
19
25
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21540428--21540528
22
4.5
22
68
26
68
62
0
23
13
1.31
21542004--21542036
17
1.9
17
88
11
50
27
0
6
66
1.15
21542231--21542367
50
2.7
51
80
7
145
36
15
10
37
1.83
21546431--21546471
16
2.5
17
85
14
52
68
4
0
26
1.10
21548914--21548961
25
1.9
25
91
8
80
25
29
16
29
1.97
21551553--21551577
9
2.8
9
100
0
50
12
0
12
76
1.04
21569366--21569404
16
2.4
17
86
8
62
17
23
10
48
1.78
21569996--21570021
9
2.9
9
100
0
52
57
19
11
11
1.63
21591832--21591870
18
2.2
18
86
13
55
58
0
2
38
1.12
21601712--21601914
37
5.5
37
85
2
275
30
30
23
15
1.95
21601700--21601914
73
2.9
74
87
3
299
30
30
24
14
1.94
21601712--21601914
110
1.8
110
89
2
318
30
30
23
15
1.95
21612604--21612647
18
2.5
18
88
3
63
15
11
13
59
1.62
21614723--21615705
491
2.0
491
99
0
1957
36
10
17
36
1.83
21632251--21632298
19
2.5
20
75
21
50
45
0
0
54
0.99
21632175--21632460
148
1.9
148
82
5
358
38
4
4
51
1.44
21632373--21632682
110
2.9
106
85
8
423
38
3
6
51
1.45
21632696--21632730
17
2.1
17
88
0
52
45
0
14
40
1.45
21634157--21634205
24
2.0
24
92
7
82
51
8
32
8
1.61
21644467--21644663
37
5.3
37
88
2
279
30
33
24
11
1.90
21651589--21651668
29
2.8
29
84
0
106
28
3
12
55
1.54
21667593--21667646
27
2.0
27
100
0
108
48
7
18
25
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21669007--21669073
31
2.2
31
86
0
89
19
17
13
49
1.80
21669989--21670063
27
2.8
27
81
4
80
25
22
18
33
1.97
21671271--21671503
40
5.8
40
87
2
324
30
20
24
24
1.99
21671271--21671515
80
3.1
80
89
0
391
30
19
24
25
1.98
21671271--21671515
120
2.0
120
88
1
357
30
19
24
25
1.98
21671790--21671887
37
2.6
37
84
7
119
27
30
18
23
1.98
21671912--21672006
38
2.5
37
76
8
111
31
25
13
29
1.94
21672000--21672050
26
2.0
26
92
0
84
27
17
25
29
1.98
21677369--21677404
14
2.6
14
90
0
54
27
25
8
38
1.84
21679102--21679141
17
2.4
17
91
0
62
60
30
2
7
1.38

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163