Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168159.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_4, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  33012953

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  135  of  160  ( 19195 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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Copy
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Period
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Period
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A
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(0-2)
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80
0
51
58
0
2
38
1.12
25527055--25527100
17
2.6
18
80
13
51
80
0
4
15
0.86
25533154--25533192
2
19.5
2
100
0
78
48
0
51
0
1.00
25534866--25534975
34
3.3
33
71
12
98
39
5
6
49
1.52
25535526--25535613
34
2.6
33
82
8
97
44
2
9
44
1.48
25536184--25536212
6
4.8
6
100
0
58
51
13
0
34
1.42
25536425--25536458
3
11.3
3
87
0
50
61
2
35
0
1.11
25539656--25539697
18
2.4
18
96
4
77
47
14
14
23
1.80
25544696--25544739
17
2.8
15
83
16
54
79
4
9
6
1.04
25545342--25545390
15
3.3
15
80
2
55
81
6
4
8
0.97
25545338--25545402
22
3.0
22
84
13
73
76
4
9
9
1.13
25551945--25551987
12
3.5
13
81
15
56
48
0
0
51
1.00
25551940--25552006
18
3.8
18
75
9
66
40
2
0
56
1.14
25562743--25562979
118
2.0
116
83
6
291
39
11
6
42
1.67
25562756--25562979
58
3.9
56
82
9
254
38
12
7
42
1.69
25562865--25563320
229
2.0
229
93
1
772
37
15
9
37
1.80
25563100--25563207
56
1.9
58
92
3
184
37
12
5
44
1.66
25565773--25566066
42
7.1
42
77
8
282
42
19
12
25
1.86
25565740--25565947
84
2.4
84
83
2
263
42
18
12
25
1.86
25565736--25566060
126
2.6
123
82
8
338
44
18
12
24
1.84
25567893--25567956
8
8.6
8
71
22
59
9
12
0
78
0.97
25567911--25567949
11
3.5
11
80
13
53
7
10
0
82
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25567891--25567987
30
3.2
29
72
20
83
10
15
0
74
1.07
25572035--25572073
20
2.0
20
89
0
60
61
10
0
28
1.28
25571950--25572288
127
2.7
124
80
6
337
40
12
5
41
1.66
25572063--25572298
58
4.0
58
75
13
221
38
11
5
44
1.63
25572182--25572635
230
2.0
229
89
3
707
39
11
8
39
1.72
25576977--25577298
40
8.1
40
78
5
237
43
11
14
29
1.81
25577522--25577888
197
1.8
199
85
7
512
45
7
7
39
1.61
25582133--25582182
25
1.9
27
84
8
68
40
0
2
58
1.10
25582687--25582780
30
3.2
30
84
4
129
53
6
7
32
1.54
25587667--25587712
22
2.1
22
84
8
58
50
4
8
36
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160