Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  63843421

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   

This is table  74  of  214  ( 25680 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21130939--21130992
12
4.8
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11
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7
11
5
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1.16
21130951--21130992
10
3.8
11
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6
50
7
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4
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1.08
21130961--21130999
11
3.2
13
86
13
57
12
5
7
74
1.20
21132361--21132421
10
6.1
10
74
12
54
32
13
24
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1.93
21132362--21132422
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3.0
20
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32
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26
27
1.93
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2.3
22
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23
1
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1.32
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0
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0
0
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0
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24
1
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3.4
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2
30
39
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3.1
21
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1.11
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3.4
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74
8
70
26
2
30
39
1.70
21162984--21163050
21
3.1
21
82
4
80
29
2
32
34
1.73
21164861--21164957
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
21167138--21167168
12
2.6
12
100
0
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25
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12
45
1.83
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6
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2
20
2
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1.9
37
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2
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16
3.8
16
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3
19
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75
1.03
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12
4.2
12
85
5
59
17
5
1
75
1.10
21168213--21168264
13
4.1
13
82
5
61
17
5
1
75
1.10
21168187--21168257
25
2.8
25
85
6
90
14
5
4
76
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21169947--21170043
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3.2
30
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2
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15
26
28
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22
2.1
22
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0
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31
4
40
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1.74
21186281--21186357
13
6.0
12
72
15
57
70
3
11
14
1.30
21186276--21186327
27
1.9
27
88
0
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67
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17
1.38
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23
2.2
25
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62
3
22
11
1.43
21197682--21197734
23
2.4
22
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20
56
9
18
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69
1.25
21201303--21201350
10
4.8
10
80
10
53
27
16
29
27
1.97
21201305--21201350
20
2.3
20
88
7
67
26
17
30
26
1.97
21201678--21201716
18
2.2
17
82
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5
17
2
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1.12
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13
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2.0
29
100
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23
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39
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25
1.69
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13
4.9
14
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20
56
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10
14
1.40
21206345--21206414
14
5.1
14
75
11
56
68
7
10
14
1.38
21208666--21208719
23
2.2
25
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15
60
62
3
22
11
1.43
21222012--21222059
20
2.4
20
67
0
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27
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1.96
21223442--21223475
18
1.9
18
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52
8
35
2
52
1.47
21224518--21224556
17
2.4
17
86
4
53
7
12
7
71
1.29
21224534--21224624
14
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13
71
20
53
14
7
4
73
1.21
21224592--21224625
11
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12
91
8
52
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2
8
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1.03
21224590--21224624
12
2.8
13
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4
54
11
2
5
80
1.00
21226003--21226050
20
2.4
20
67
0
51
33
18
27
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21226441--21226484
21
2.1
21
91
0
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31
4
34
29
1.78
21226466--21226509
22
2.0
23
90
4
72
22
4
31
40
1.74
21228420--21228465
10
4.4
11
86
8
69
13
6
2
78
1.04
21228420--21228465
21
2.2
21
96
0
83
13
6
2
78
1.04
21231121--21231169
20
2.5
20
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0
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12
30
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53
1.57
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12
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15
54
75
4
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13
1.17
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13
9
1.36
21239505--21239591
41
2.2
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5
8
12
1.23
21239555--21239627
29
2.6
28
81
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87
68
8
13
9
1.39
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1.9
18
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11
54
57
0
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22
1.41
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22
2.0
22
95
0
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4
36
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1.76
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30
3.2
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97
29
15
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28
1.96
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30
3.1
30
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3
98
29
25
16
29
1.96
21251296--21251349
20
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20
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18
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21
20
18
39
1.93
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20
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16
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23
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16
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1.93
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15
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13
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2
6
20
1.16
21253043--21253082
17
2.4
17
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75
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12
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1.18
21253043--21253082
18
2.3
17
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53
75
5
12
7
1.18
21252989--21253081
42
2.2
42
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100
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29
2.6
29
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10
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13
10
1.26
21254125--21254158
18
1.9
18
88
5
52
52
2
35
8
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21255424--21255477
20
2.7
20
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0
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24
20
18
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1.94
21255424--21255497
30
2.5
30
86
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98
21
20
18
39
1.93
21255424--21255488
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
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12
2.2
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100
0
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2.5
22
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2
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76
7
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9
1.16
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21
2.8
21
82
5
77
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0
18
3
0.88
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101
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16
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1
18
2
0.96
21259036--21259085
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6
85
14
59
78
0
20
2
0.86
21259040--21259098
27
2.5
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78
21
68
77
0
18
3
0.90
21259146--21259176
12
2.6
12
100
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45
12
16
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30
3.1
30
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3
98
29
25
16
29
1.96
21264174--21264204
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
21264265--21264314
6
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6
81
16
50
2
20
2
76
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21264254--21264324
37
1.9
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11
101
2
18
2
76
1.04
21264250--21264310
16
3.8
16
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14
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3
19
1
75
1.03
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30
3.2
30
75
2
97
29
15
25
28
1.96
21283630--21283701
29
2.5
29
93
0
117
45
12
9
31
1.74
21284739--21284780
16
2.7
15
85
7
57
9
11
4
73
1.22
21288479--21288540
10
5.9
10
74
10
52
33
30
3
32
1.74
21288500--21288540
21
2.0
21
95
0
73
31
29
2
36
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21289257--21289322
26
2.6
27
80
9
75
30
7
15
46
1.73
21292924--21292968
12
3.7
12
79
5
54
37
0
6
55
1.26
21292918--21292958
13
3.2
13
79
6
57
34
0
7
58
1.26
21292918--21292968
25
2.0
25
100
0
102
35
0
7
56
1.28
21293795--21293827
15
2.1
16
88
5
50
9
0
18
72
1.10
21298465--21298498
11
3.0
11
87
8
50
76
8
2
11
1.12
21298465--21298525
12
4.8
12
79
16
70
73
6
4
14
1.20
21298466--21298537
13
5.7
12
77
16
65
75
4
6
13
1.17
21298477--21298537
28
2.2
28
82
5
70
73
3
8
14
1.19
21298530--21298568
15
2.7
14
78
21
53
66
10
15
7
1.43
21298466--21298551
40
2.2
39
83
10
104
73
5
8
12
1.24
21298518--21298586
29
2.4
29
81
9
81
68
5
15
10
1.37
21299461--21299495
18
1.9
18
88
11
54
57
0
20
22
1.41
21304566--21304614
13
3.7
13
82
17
57
73
4
8
14
1.21
21304565--21304615
14
3.8
13
77
12
50
74
3
7
13
1.18
21306871--21306924
23
2.2
25
78
15
60
62
3
22
11
1.43
21315098--21315155
6
9.7
6
76
0
62
74
3
18
3
1.11
21315098--21315139
18
2.3
18
95
0
75
76
4
16
2
1.07
21315098--21315200
12
8.6
12
72
19
63
69
2
19
7
1.26
21322003--21322035
17
1.9
17
93
0
57
24
6
3
66
1.28
21323746--21323808
21
3.0
21
88
2
81
33
31
4
30
1.78
21324106--21324144
14
2.8
14
88
0
60
76
0
12
10
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21324106--21324145
15
2.8
15
81
11
57
77
0
12
10
0.99
21324588--21324614
14
1.9
14
100
0
54
14
3
29
51
1.60
21327852--21327896
19
2.3
20
84
7
65
77
2
13
6
1.05
21333779--21333822
22
2.0
22
95
0
79
25
36
4
34
1.76
21336422--21336452
12
2.7
11
90
9
53
67
9
3
19
1.33
21337866--21337959
46
2.0
46
93
4
163
35
22
18
24
1.96
21343401--21343497
30
3.2
30
75
2
106
28
26
15
28
1.96
21346153--21346223
37
1.9
37
86
11
101
76
2
18
2
1.04
21346163--21346212
6
8.2
6
83
14
50
76
2
20
2
0.99
21346273--21346303
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214