Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  63843421

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   

This is table  76  of  214  ( 25680 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21486677--21486702
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2.2
12
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0
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15
0
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10
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29
14
26
29
1.95
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1.9
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83
12
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51
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1
71
1.21
21490040--21490096
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75
16
57
8
17
1
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1.19
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0
52
0
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1
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0.82
21491177--21491229
11
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19
60
1
13
1
83
0.82
21491178--21491229
12
4.3
12
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7
61
1
11
1
84
0.78
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12
2.7
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4
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12
30
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20
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8
20
3
67
1.32
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14
3.5
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20
50
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6
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1.17
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11
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0
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14
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5
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1.19
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20
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20
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12
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1.92
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85
12
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55
1.60
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4.2
13
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19
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9
18
1
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1.22
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18
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17
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5
18
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69
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2.8
28
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18
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15
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3.4
11
88
0
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16
5
5
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20
2.8
21
80
20
66
33
12
23
30
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
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12
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1.60
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10.0
12
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19
63
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19
3
68
1.29
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2.1
27
84
9
73
8
19
1
70
1.23
21504035--21504071
14
2.7
14
84
15
51
8
16
0
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1.02
21504080--21504136
17
3.3
17
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62
5
17
7
70
1.29
21504033--21504152
57
2.1
55
82
10
136
7
20
3
69
1.28
21504033--21504139
6
17.7
6
67
7
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6
19
3
70
1.26
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15
3.5
15
75
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15
5
75
1.13
21505215--21505251
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3.4
11
88
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5
5
72
1.21
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80
20
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12
23
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1.92
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33
1.9
33
84
12
85
12
25
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55
1.60
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21
2.7
21
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8
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1
71
1.21
21508742--21508798
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4.1
14
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16
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17
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71
1.19
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17
3.0
17
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59
5
19
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69
1.30
21508807--21508866
11
5.3
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1.25
21508760--21508866
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17.7
6
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70
1.26
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15
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15
75
14
56
3
15
5
75
1.13
21509942--21509978
11
3.4
11
88
0
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16
5
5
72
1.21
21511333--21511388
20
2.8
21
80
20
66
33
12
23
30
1.92
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54
2.4
54
80
9
146
14
25
3
57
1.52
21511771--21511802
15
2.1
16
94
5
57
6
21
0
71
1.07
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41
2.1
41
91
0
136
29
17
17
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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8
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73
4
4
17
1.15
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15
3.6
15
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4
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5
12
21
1.53
21515453--21515505
16
3.4
16
94
5
99
62
5
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20
1.49
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52
2.1
52
98
0
213
33
9
12
45
1.74
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22
2.3
21
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6
66
35
33
3
27
1.75
21517232--21517294
21
3.0
21
85
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72
33
30
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31
1.78
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20
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16
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15
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16
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5
57
71
0
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6
1.07
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1.9
18
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5
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52
2
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2.7
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0
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24
20
18
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1.94
21524757--21524830
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
21524757--21524821
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
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15
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15
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75
1
20
1
0.99
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11
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0
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0
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2.0
22
95
0
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36
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1.76
21540566--21540591
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13
100
0
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0
30
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1.58
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1.9
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15
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31
1.75
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11
2.6
13
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3
6
15
1.14
21552915--21552992
40
2.0
40
87
5
113
74
6
8
10
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21552942--21552992
14
3.8
13
76
21
52
78
7
7
5
1.09
21553712--21553745
15
2.3
15
89
0
50
35
29
32
2
1.73
21557640--21557740
52
2.0
50
82
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123
33
15
13
36
1.88
21560413--21560459
23
2.1
23
84
7
62
51
12
4
31
1.59
21564457--21564495
18
2.2
18
85
0
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23
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1.43
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2.0
46
91
4
154
36
21
18
24
1.95
21573402--21573441
18
2.2
18
86
4
53
12
27
0
60
1.33
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15
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15
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2
101
16
10
5
67
1.39
21574501--21574558
16
3.7
16
95
4
109
17
12
5
65
1.43
21574598--21574640
12
3.5
12
87
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59
11
4
9
74
1.20
21574598--21574640
13
3.4
13
83
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52
11
4
9
74
1.20
21574958--21575051
46
2.0
46
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4
154
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18
24
1.95
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16
3.4
16
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87
19
8
5
66
1.39
21576646--21576681
12
2.8
13
91
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56
19
5
2
72
1.17
21577670--21577716
23
2.1
23
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62
51
12
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1.59
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4
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0
0
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0
56
25
0
0
75
0.81
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21
3.0
22
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4
71
30
3
30
36
1.73
21592546--21592575
14
2.1
14
100
0
60
26
0
13
60
1.34
21596262--21596311
6
8.3
6
86
0
73
76
0
20
4
0.95
21596260--21596307
24
2.0
24
95
0
87
72
0
20
6
1.05
21596323--21596362
17
2.4
16
84
15
55
77
2
12
7
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21598051--21598094
22
2.0
22
95
0
79
34
4
36
25
1.76
21601232--21601278
23
2.1
23
84
7
62
51
12
4
31
1.59
21610230--21610269
18
2.2
18
86
4
53
12
27
0
60
1.33
21611332--21611383
13
4.0
13
87
7
79
25
11
1
61
1.40
21611421--21611467
13
3.5
13
88
2
67
10
4
8
76
1.13
21611421--21611467
14
3.4
14
85
5
69
10
4
8
76
1.13
21617186--21617250
20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
1.93
21618516--21618549
18
1.9
18
88
5
52
8
35
2
52
1.47
21618632--21618663
15
2.1
16
94
5
57
6
21
0
71
1.07
21619637--21619666
11
2.6
11
94
5
51
6
3
6
83
0.90
21619726--21619759
13
2.5
14
95
4
61
5
2
5
85
0.83
21621263--21621327
20
3.3
19
73
16
51
38
16
21
23
1.93
21624366--21624422
12
4.5
12
79
16
53
75
3
10
10
1.16
21624419--21624460
18
2.3
18
87
0
57
71
4
16
7
1.26
21627603--21627649
20
2.3
20
92
0
76
25
34
17
23
1.96
21627614--21627651
10
3.8
10
83
13
51
28
28
15
26
1.96
21629174--21629240
23
2.8
24
78
15
68
76
2
16
4
1.08
21629173--21629240
24
2.9
24
78
8
68
76
2
16
4
1.07
21631939--21631985
20
2.3
20
92
0
76
25
34
17
23
1.96
21631950--21631987
10
3.8
10
83
13
51
28
28
15
26
1.96
21633281--21633358
39
2.0
40
89
2
122
34
30
17
16
1.93
21633574--21633761
45
4.2
45
93
0
304
26
20
14
38
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21635334--21635556
80
2.8
79
82
3
232
24
21
28
26
1.99
21635387--21635556
40
4.3
40
90
0
234
23
21
28
26
1.99
21635409--21635591
79
2.3
80
82
1
226
25
20
28
25
1.99
21643238--21643462
40
5.7
40
83
4
222
24
20
28
26
1.99
21643291--21643460
40
4.3
40
89
0
225
23
20
28
27
1.99
21643313--21643495
79
2.3
80
81
1
217
25
20
28
26
1.99
21650125--21650169
17
2.7
16
83
10
54
17
6
4
71
1.25
21650123--21650166
18
2.5
17
81
3
52
13
9
4
72
1.24
21650948--21651135
45
4.2
45
94
0
313
25
20
14
38
1.91
21655391--21655424
11
3.2
10
91
8
50
76
11
2
8
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214