Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  63843421

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   

This is table  90  of  214  ( 25680 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25727242--25727312
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1.9
37
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11
101
2
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1.04
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6
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0
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3.2
30
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2
106
28
26
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28
1.96
25732148--25732197
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99
25732137--25732207
37
1.9
37
86
11
101
2
18
2
76
1.04
25732133--25732193
16
3.8
16
77
14
63
3
19
1
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1.03
25735419--25735480
5
12.0
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75
1
19
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1.02
25735409--25735478
36
1.9
37
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13
101
75
2
18
2
1.05
25735508--25735604
30
3.2
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71
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14
27
28
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4
60
29
24
14
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25736099--25736158
20
3.0
20
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2
84
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3.4
23
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2
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21
3.1
21
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29
2
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34
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17
3.2
17
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1.17
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3.9
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10
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15
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1
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1.18
25745480--25745527
12
3.7
13
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12
8
2
77
1.08
25745790--25745867
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3.4
23
74
8
70
26
2
30
39
1.70
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3.1
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29
2
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0
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19
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19
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13
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71
0
23
5
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25766665--25766704
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2.2
18
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4
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2.3
20
85
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36
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1.91
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3.6
12
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8
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10
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1.21
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0
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5
15
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1.9
18
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57
0
20
22
1.41
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4
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22
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25796644--25796704
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8
29
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1.86
25797935--25797987
23
2.4
22
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20
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20
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40
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18
2.3
18
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25813888--25813984
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
25816166--25816196
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
25816257--25816306
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99
25816246--25816316
37
1.9
37
86
11
101
2
18
2
76
1.04
25816242--25816302
16
3.8
16
77
14
63
3
19
1
75
1.03
25817233--25817284
10
4.7
11
80
15
54
11
7
5
75
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25817233--25817274
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11
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3
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9
9
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1.15
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22
2.4
22
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63
11
7
5
75
1.18
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30
3.2
30
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2
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28
15
26
28
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1.9
13
100
0
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16
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16
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38
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23
1.93
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33
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6
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3
72
1.21
25832514--25832590
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5
9
12
1.25
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20
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7
14
1.16
25832568--25832608
17
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17
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73
7
14
4
1.22
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20
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21
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23
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56
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69
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0
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100
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8
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1.38
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21
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37
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1.68
25854912--25854974
21
3.0
21
83
2
63
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33
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28
1.73
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11
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1.08
25856862--25856904
22
2.0
22
100
0
86
13
4
2
79
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25857025--25857138
57
2.0
57
100
0
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17
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1.94
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0
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0
0
22
0.76
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20
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2.5
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21
20
18
39
1.93
25869972--25870036
20
3.2
20
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16
53
23
21
16
38
1.93
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2.7
13
95
4
63
80
0
8
11
0.90
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2.3
18
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0
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75
7
14
2
1.12
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6
19.7
6
66
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51
70
2
18
8
1.24
25878621--25878670
18
2.7
18
81
3
64
68
0
18
14
1.22
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2.1
19
100
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20
23
20
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1.96
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77
98
0
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32
20
16
30
1.95
25883340--25883382
19
2.1
21
83
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54
6
30
0
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1.21
25884344--25884401
17
3.5
17
86
9
84
22
10
5
62
1.47
25884344--25884398
15
3.4
16
90
7
85
21
9
5
63
1.44
25884439--25884495
11
4.9
11
85
8
60
17
5
3
73
1.16
25884441--25884499
12
4.9
12
87
6
75
16
5
5
72
1.20
25884441--25884496
25
2.3
24
87
3
76
14
5
3
76
1.09
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19
2.0
19
100
0
76
21
21
21
36
1.95
25886468--25886521
20
2.7
20
82
0
63
24
20
18
37
1.94
25886468--25886541
30
2.5
30
86
8
98
21
20
18
39
1.93
25886468--25886532
20
3.2
20
71
16
53
23
21
16
38
1.93
25887999--25888038
16
2.6
15
76
7
53
65
5
5
25
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25903173--25903254
29
2.8
30
67
22
75
32
7
13
46
1.71
25904461--25904510
13
3.8
13
86
5
73
70
0
8
22
1.13
25904463--25904511
14
3.6
14
88
2
73
73
0
6
20
1.04
25906361--25906397
13
2.8
13
95
4
65
64
2
13
18
1.39
25907319--25907363
18
2.5
17
82
13
54
73
4
13
8
1.23
25907353--25907395
19
2.2
19
83
8
50
60
2
27
9
1.40
25913278--25913335
15
3.7
15
95
4
98
18
12
5
63
1.46
25913373--25913430
12
4.9
12
89
4
91
15
1
8
74
1.14
25913373--25913430
23
2.5
24
94
2
100
15
1
8
74
1.14
25914419--25914465
23
2.1
23
84
7
62
51
12
4
31
1.59
25922469--25922531
33
1.9
33
84
12
85
12
25
6
55
1.60
25922529--25922584
21
2.7
21
72
5
51
8
17
1
71
1.21
25922528--25922584
14
4.1
14
75
16
57
8
17
1
71
1.19
25922546--25922649
18
5.6
18
73
10
84
6
18
3
71
1.24
25922546--25922653
6
17.7
6
70
5
74
6
18
3
71
1.23
25923710--25923742
10
3.2
10
95
4
57
3
9
0
87
0.63
25923713--25923755
12
3.8
12
87
6
54
6
4
2
86
0.79
25923723--25923761
12
3.2
12
92
0
60
12
2
5
79
1.00
25925863--25926034
40
4.3
40
88
2
213
25
27
22
25
2.00
25925863--25926087
80
2.8
78
79
7
220
25
27
21
25
1.99
25926019--25926096
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
25932182--25932352
40
4.3
40
87
3
211
26
28
20
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25935122--25935163
18
2.3
18
87
0
57
71
4
16
7
1.26
25942978--25943044
28
2.4
28
87
5
91
52
11
7
28
1.65
25943561--25943613
26
2.1
25
82
6
63
32
22
5
39
1.78
25945697--25945755
20
3.0
20
80
14
68
33
11
28
25
1.91
25948686--25948762
22
3.3
23
75
5
66
28
3
29
37
1.75
25955222--25955252
11
2.7
11
95
5
53
12
9
0
77
0.99
25955533--25955609
22
3.3
23
75
5
66
28
3
29
37
1.75
25959549--25959591
11
3.8
12
81
12
63
16
6
2
74
1.14
25960940--25960998
20
3.0
20
80
14
68
33
11
28
25
1.91
25962954--25963015
10
5.9
10
74
10
52
33
32
3
30
1.74

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214