Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: D12
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  63843421

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   

This is table  89  of  214  ( 25680 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25371283--25371322
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13
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0
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2.7
18
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1.73
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4.3
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21
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2.2
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5
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0
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2.5
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2.1
22
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0
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0
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2.0
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2.1
31
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0
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0
34
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
18
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10
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1.18
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2
0
24
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48
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1.30
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27
22
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2.00
25460203--25460462
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27
22
25
2.00
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1.9
13
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0
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0
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2.0
43
97
0
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17
14
36
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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2.3
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1.16
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50
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26
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1.99
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25
76
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1.98
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87
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1
679
22
28
21
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1.99
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673
23
28
21
27
1.99
25543840--25544272
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679
22
28
21
27
1.99
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2.1
60
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144
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12
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0
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1.14
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1.07
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11
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72
1.27
25551984--25552019
18
2.1
16
90
10
54
61
0
5
33
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25559239--25559283
24
1.9
23
90
4
72
42
4
4
48
1.43
25561372--25561415
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2.3
20
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7
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29
20
9
40
1.83
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40
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40
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21
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20
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1.98
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45
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15
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1.96
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15
23
30
1.96
25569228--25570216
134
7.4
134
86
3
1176
30
15
23
30
1.96
25571403--25571466
22
2.7
24
83
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40
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46
1.53
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2.0
45
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144
34
15
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1.85
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34
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6
84
33
5
14
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1.66
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2.2
18
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25
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1.63
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0
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14
22
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8
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0
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0
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0
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1.41
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131
31
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16
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16
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0
90
31
35
0
33
1.58
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4
12.5
4
95
0
91
48
26
2
24
1.62
25626035--25626223
41
4.5
41
88
3
252
19
22
22
35
1.96
25626035--25626223
84
2.3
83
89
0
288
19
22
22
35
1.96
25630464--25630962
36
14.2
34
79
10
126
34
1
17
46
1.57
25630538--25630965
9
48.2
9
79
8
448
34
0
16
47
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25638103--25638340
115
2.1
114
91
2
379
32
20
19
28
1.97
25638811--25638871
21
2.9
21
73
9
61
45
32
3
18
1.65
25638841--25638873
14
2.4
14
95
5
59
45
33
6
15
1.70
25639003--25639052
20
2.5
21
83
6
68
48
38
0
14
1.44
25641834--25641941
37
3.0
33
74
16
90
50
3
2
42
1.34
25641840--25641894
25
2.2
25
81
12
60
49
5
1
43
1.36
25649050--25649259
27
8.0
27
79
8
175
35
18
20
26
1.95
25649050--25649259
54
4.0
55
76
10
197
35
18
20
26
1.95
25649033--25649224
77
2.5
77
81
7
219
37
18
18
26
1.93
25649259--25649319
27
2.3
27
83
11
72
19
22
22
34
1.97
25649366--25649450
32
2.7
32
78
10
93
21
17
24
36
1.94
25649426--25649531
32
3.3
31
79
7
106
20
21
20
36
1.95
25649431--25649577
64
2.3
64
85
2
188
20
21
21
36
1.96
25649444--25649569
32
3.9
32
78
4
119
19
22
20
37
1.95
25649588--25649653
22
3.0
21
75
4
60
16
24
18
40
1.90
25649647--25649699
26
2.0
26
88
0
79
22
28
16
32
1.96
25653212--25653249
14
2.7
14
87
0
58
78
5
13
2
1.02
25655755--25655812
28
2.1
28
100
0
116
32
17
13
36
1.89
25657924--25657985
9
6.9
9
74
5
54
72
0
3
24
0.99
25657924--25657983
27
2.2
27
84
0
75
71
0
3
25
1.01
25660388--25660581
98
2.0
97
92
3
327
36
24
10
28
1.89
25662498--25663098
45
13.7
44
73
11
312
26
22
21
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25662511--25663180
218
3.1
218
93
0
1124
26
22
21
29
1.99
25702614--25702649
11
3.2
11
88
7
54
63
8
2
25
1.36
25702687--25702725
15
2.6
15
95
0
69
66
2
12
17
1.35
25705653--25705688
7
5.3
7
96
3
65
16
11
16
55
1.68
25705653--25705696
14
3.1
14
90
6
54
18
11
15
54
1.70
25706308--25706373
13
5.2
12
74
16
53
74
4
13
7
1.20
25711570--25711606
7
5.3
7
96
0
65
16
10
16
56
1.66
25719318--25719366
12
4.1
12
83
0
62
69
2
6
22
1.21
25727116--25727212
30
3.2
30
75
2
106
28
26
15
28
1.96
25727253--25727302
6
8.2
6
81
16
50
2
20
2
76
0.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214