Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D10
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  65706892

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   

This is table  86  of  218  ( 26060 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25008902--25008943
21
2.0
21
81
9
50
38
35
0
26
1.57
25009019--25009051
14
2.4
14
89
0
57
51
27
0
21
1.48
25009598--25009936
177
1.9
178
88
1
511
26
23
22
28
1.99
25011774--25011821
23
2.0
24
84
4
62
50
14
8
27
1.71
25016115--25016161
20
2.2
21
85
7
60
55
0
0
44
0.99
25019169--25019208
21
1.9
21
85
10
55
67
2
2
27
1.16
25020998--25021026
12
2.5
12
94
5
51
55
0
0
44
0.99
25022601--25022648
18
2.7
18
73
0
51
66
2
0
31
1.03
25033869--25033899
2
16.0
2
93
6
55
0
51
0
48
1.00
25038204--25038242
20
2.0
20
85
10
53
43
2
0
53
1.14
25038399--25038437
19
2.0
20
90
10
62
46
0
5
48
1.24
25038499--25038576
26
2.9
27
80
16
81
39
5
1
53
1.31
25038560--25038617
16
3.8
16
75
11
68
44
0
0
55
0.99
25041838--25041932
22
4.3
22
74
2
73
31
18
13
35
1.90
25041881--25041945
22
3.0
21
74
17
60
27
15
16
40
1.89
25043407--25043439
16
2.1
16
94
0
57
36
15
18
30
1.91
25047121--25047171
14
3.4
14
76
12
57
74
7
3
13
1.18
25047121--25047171
16
3.4
15
77
20
54
74
7
3
13
1.18
25054159--25054264
52
2.1
51
87
8
153
47
6
12
33
1.67
25054272--25054334
20
3.1
20
64
28
51
39
11
4
44
1.61
25054402--25054524
41
3.1
41
65
21
116
42
15
4
37
1.68
25054499--25054546
23
2.1
23
100
0
96
37
20
4
37
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25054789--25054824
15
2.4
15
100
0
72
36
8
11
44
1.70
25055053--25055090
11
3.5
11
88
0
58
21
5
21
52
1.66
25056621--25056678
25
2.3
24
82
8
62
46
0
3
50
1.18
25056499--25056703
88
2.3
91
88
3
299
45
3
4
46
1.39
25056720--25057731
120
8.4
120
97
0
1900
41
2
5
50
1.39
25056844--25056894
15
3.5
15
82
12
54
45
0
1
52
1.12
25056964--25057015
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25057084--25057135
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25057209--25057255
15
3.3
15
82
11
55
44
0
2
53
1.12
25057324--25057375
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25057449--25057495
15
3.3
15
82
11
55
44
0
2
53
1.12
25057564--25057615
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25057693--25057734
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
25057684--25057725
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
25057875--25057969
45
2.1
44
84
5
120
37
27
4
30
1.76
25057948--25057996
16
3.1
16
93
0
80
26
36
2
34
1.68
25064058--25064135
15
5.2
15
67
11
61
44
7
21
25
1.79
25064054--25064135
30
2.8
30
94
1
139
46
7
21
24
1.77
25068715--25068822
15
7.2
15
69
12
87
43
7
23
25
1.79
25068708--25068822
30
3.8
30
97
0
203
44
6
23
25
1.78
25071299--25071323
12
2.1
12
100
0
50
8
8
32
52
1.60
25084635--25084726
25
3.5
26
67
8
69
58
5
1
34
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25085036--25085066
16
1.9
16
93
0
53
25
19
6
48
1.72
25085772--25085831
25
2.4
25
91
5
86
26
15
13
45
1.83
25086237--25086286
17
2.9
17
87
0
82
46
4
26
24
1.70
25089819--25089868
17
2.9
17
93
0
82
48
6
22
24
1.73
25104827--25105018
40
4.8
41
86
3
246
25
21
23
29
1.99
25105321--25105397
28
2.6
30
71
18
74
23
2
25
48
1.64
25106036--25106085
21
2.4
21
86
6
75
20
0
46
34
1.51
25106036--25106085
7
7.1
7
80
8
57
20
0
46
34
1.51
25106836--25106880
23
1.9
24
90
4
74
55
8
13
22
1.65
25109855--25109882
2
14.0
2
100
0
56
0
50
0
50
1.00
25115500--25115706
91
2.3
91
92
1
335
45
2
4
46
1.37
25115622--25115682
28
2.2
28
85
5
81
45
0
3
50
1.17
25115540--25115682
44
3.2
43
69
20
121
46
2
3
48
1.31
25116088--25116139
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25115722--25116495
120
6.4
120
97
1
1340
41
2
6
50
1.39
25116208--25116259
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25116328--25116379
15
3.6
15
80
12
56
44
0
1
53
1.11
25116457--25116498
15
2.7
16
82
14
52
45
0
2
52
1.13
25116448--25116489
15
2.9
15
82
10
52
47
0
0
52
1.00
25116712--25116758
16
2.9
16
90
0
76
23
34
2
40
1.67
25118134--25118221
42
2.1
43
84
2
115
23
13
30
31
1.93
25118145--25118227
43
2.0
42
85
2
112
25
14
28
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25118222--25118270
20
2.5
20
90
9
75
51
0
4
44
1.20
25132415--25132467
23
2.3
23
83
6
63
30
16
16
35
1.92
25132775--25132874
49
2.1
48
83
5
121
29
18
32
21
1.96
25132820--25133041
96
2.3
96
85
0
318
30
18
31
20
1.96
25132750--25133038
48
6.0
48
71
3
177
30
18
30
20
1.96
25138171--25138613
159
2.8
158
84
5
529
33
22
17
26
1.96
25138641--25139240
73
8.2
73
86
6
736
32
20
17
30
1.95
25152824--25152871
20
2.3
20
78
3
60
37
2
60
0
1.09
25155043--25155088
14
3.4
14
77
17
51
34
0
10
54
1.36
25155031--25155088
27
2.1
28
87
3
82
36
0
10
53
1.35
25155797--25155834
17
2.3
17
86
4
51
39
2
2
55
1.28
25157770--25157839
25
2.9
25
72
8
74
52
0
0
47
1.00
25157755--25157865
20
5.1
21
67
20
68
54
0
0
45
1.06
25159974--25160005
14
2.2
15
94
5
57
25
6
0
68
1.12
25160091--25160131
21
2.0
21
85
4
57
36
0
7
56
1.27
25160116--25160180
25
2.5
25
80
5
67
30
4
6
58
1.43
25160148--25160204
27
2.1
27
86
0
78
29
5
3
61
1.35
25161445--25161492
25
1.9
25
87
8
71
33
0
2
64
1.05
25165889--25165961
29
2.5
29
95
0
137
45
17
13
23
1.84
25165987--25166049
32
2.0
32
87
0
90
25
19
15
39
1.91
25166087--25166140
28
2.0
27
82
10
65
29
18
11
40
1.85
25168180--25168209
12
2.5
12
94
0
51
76
13
3
6
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25168550--25169108
107
5.2
106
80
11
591
59
15
0
24
1.41
25183870--25183912
18
2.6
16
81
7
50
62
0
25
11
1.29
25186708--25186752
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
25190040--25190084
22
2.0
22
91
0
72
33
2
15
48
1.57
25193263--25193334
19
3.6
21
69
14
62
43
0
4
52
1.20
25193794--25193820
13
2.1
13
100
0
54
40
22
7
29
1.81
25194906--25194935
15
2.0
15
93
0
51
10
6
10
73
1.25
25196505--25196573
19
3.4
19
72
14
66
43
2
0
53
1.15
25196505--25196573
31
2.3
30
82
9
86
43
2
0
53
1.15
25198147--25198179
17
1.9
18
88
11
52
33
15
6
45
1.70
25199180--25199242
28
2.2
28
97
0
117
30
23
23
22
1.99
25199604--25199683
27
3.0
27
83
0
106
20
13
21
45
1.85
25199608--25199693
27
3.2
27
80
3
102
17
13
19
48
1.80
25203496--25203543
24
2.0
25
83
4
62
35
6
16
41
1.74
25203529--25203588
21
2.9
21
80
5
68
25
8
20
46
1.78
25209567--25209610
23
1.9
22
82
17
54
36
25
0
38
1.56
25209657--25209748
45
2.0
45
89
0
139
32
20
17
29
1.96
25209754--25209940
51
3.7
50
81
4
223
29
28
18
22
1.97
25209751--25209936
101
1.8
99
85
5
248
30
28
18
22
1.97
25215003--25215134
67
2.0
67
95
0
237
27
31
19
21
1.98
25215256--25215365
57
1.9
57
83
7
143
26
25
18
30
1.98
25225394--25225441
21
2.3
21
100
0
96
35
0
35
29
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25225394--25225448
21
2.6
21
94
0
83
34
0
38
27
1.57
25226258--25226308
21
2.6
19
81
9
66
15
3
3
76
1.08
25231040--25231185
28
5.2
28
82
8
190
32
23
21
22
1.98
25231287--25231367
26
3.1
26
82
7
119
33
22
22
22
1.97
25231568--25231636
27
2.6
27
97
0
129
28
15
15
39
1.89
25231588--25231704
27
4.3
27
82
8
114
26
16
19
37
1.93
25231602--25231841
54
4.6
53
75
17
182
22
15
18
43
1.88
25231590--25231952
82
4.6
81
75
12
263
24
14
18
42
1.87
25231629--25231760
27
4.9
27
85
1
169
23
15
17
43
1.86
25231741--25231777
17
2.2
17
90
9
58
18
18
21
40
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218