Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr8
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  78745976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   

This is table  225  of  235  ( 28198 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75972463--75972496
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0
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2.0
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100
0
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1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.86
76013717--76013776
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3.3
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4
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1.85
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2.00
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0
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1.58
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3
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206
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0
0
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26
1.98
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22
2.5
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26
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2.0
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3.0
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2
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1.96
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2.3
84
96
0
363
28
19
22
29
1.98
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12
0
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2.2
57
98
0
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10
1
43
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
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18
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1.97
76095529--76096330
100
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1041
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106
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18
1.22
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1.36
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30
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1.99
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13
2.0
13
100
0
52
23
38
15
23
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76138723--76138782
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19
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1
1
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2.5
19
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10
60
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0
0
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19
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5
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1.51
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10
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68
27
1
1
69
1.07
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2.1
28
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12
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27
1
1
69
1.07
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2.0
41
97
0
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41
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7
16
1.76
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108
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17
20
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1.96
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21
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1
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1.31
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48
2.5
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1
38
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1
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1
1.08
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1.58
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24
2.4
24
82
8
71
62
7
26
3
1.38
76166006--76166082
35
2.2
35
95
0
136
25
16
24
32
1.96
76170124--76170148
13
1.9
13
100
0
50
48
0
8
44
1.32
76170284--76170310
3
9.0
3
100
0
54
66
0
0
33
0.92
76170463--76170503
15
2.6
16
84
7
57
56
0
0
43
0.99
76170593--76170670
20
4.0
19
75
11
77
52
1
8
37
1.41
76174160--76174198
13
3.1
13
85
14
55
53
0
2
43
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76174408--76174482
15
5.6
13
73
17
57
61
1
6
30
1.30
76181618--76181671
8
6.9
8
76
16
51
44
1
0
53
1.11
76181616--76181671
16
3.6
16
77
20
64
44
1
0
53
1.11
76181627--76181681
22
2.5
21
82
8
65
50
1
0
47
1.11
76181620--76181710
35
2.5
37
87
7
123
50
1
0
48
1.08
76184771--76184825
28
2.0
28
88
0
83
25
12
16
45
1.83
76198019--76198075
10
5.4
11
78
14
57
78
0
3
17
0.88
76198019--76198075
22
2.7
22
79
15
66
78
0
3
17
0.88
76198024--76198075
16
3.3
15
75
21
52
80
0
3
15
0.85
76202467--76202855
194
2.0
194
98
0
751
22
30
15
31
1.95
76203130--76203258
51
2.5
51
78
0
159
40
13
6
39
1.70
76208683--76208881
102
2.0
102
87
2
292
29
18
12
40
1.87
76211021--76211170
58
2.6
58
80
3
149
33
21
14
31
1.93
76217223--76217286
13
4.9
13
78
0
65
39
18
6
35
1.76
76219831--76219946
50
2.3
50
82
2
126
23
19
19
37
1.95
76221480--76221522
17
2.5
18
88
7
63
11
27
20
39
1.88
76221497--76221603
29
3.7
29
73
13
94
13
28
18
40
1.88
76222170--76222194
13
1.9
13
100
0
50
48
12
16
24
1.79
76222845--76222917
28
2.6
29
80
10
89
57
6
12
23
1.59
76228468--76228564
23
4.2
23
76
9
90
20
23
20
35
1.96
76237957--76237991
14
2.5
14
100
0
70
28
5
20
45
1.73
76239519--76239673
18
9.0
17
65
22
74
42
1
1
54
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76239565--76239607
22
1.9
23
85
4
61
37
0
2
60
1.10
76239311--76239703
120
3.3
120
96
0
714
41
1
3
52
1.27
76239311--76239815
120
4.2
116
88
7
563
42
1
3
51
1.31
76239759--76239793
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
76239759--76239813
15
3.4
16
80
16
53
47
0
1
50
1.11
76239311--76239815
241
2.1
239
87
6
718
42
1
3
51
1.31
76240029--76240097
16
4.2
16
96
3
129
37
37
0
24
1.56
76240029--76240097
33
2.1
32
97
2
129
37
37
0
24
1.56
76243670--76243746
14
5.0
15
71
20
52
42
15
9
32
1.78
76243686--76243725
20
2.0
20
90
0
62
50
12
10
27
1.72

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235