Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: At_chr8
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  78745976

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   

This is table  228  of  235  ( 28198 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76737925--76738235
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29
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0
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1.54
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0
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2
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0
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1.51
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101
2.2
105
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10
326
45
26
0
27
1.54
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132
2.0
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18
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76740881--76741352
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2
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16
29
1.96
76740881--76741352
251
1.9
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21
16
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1.96
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25
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25
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2
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0
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2.1
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100
0
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0
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2
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76763007--76763210
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2.4
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1
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26
29
19
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1.98
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95
2.0
95
90
1
299
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16
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13
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24
2.2
25
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63
24
0
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254
2.3
243
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12
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2.0
19
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2.0
20
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2.9
29
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39
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0
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118
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25
23
25
2.00
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22
26
2.00
76771664--76771711
23
2.2
21
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14
53
31
2
22
43
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76774735--76774772
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10
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0
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76777089--76777175
25
3.5
25
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0
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19
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25
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50
1.9
50
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4
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19
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20
35
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25
2.5
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3
7
42
1.48
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24
2.7
27
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1
5
37
1.32
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3
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137
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0
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48
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2.4
23
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1.22
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16
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15
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76781647--76781715
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1.54
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2
0
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17
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21
2
0
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19
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1.80
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4.1
9
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0
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10
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1.80
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2.0
20
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4
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0
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14
1.22
76807499--76807539
7
6.0
7
78
16
50
68
0
17
14
1.22
76807500--76807539
13
3.0
13
89
10
55
67
0
17
15
1.23
76808803--76809936
89
12.8
89
88
2
1199
31
17
23
27
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76809033--76809957
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2.3
400
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3
1200
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16
24
28
1.97
76808972--76809980
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2.1
490
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4
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23
28
1.97
76815554--76815584
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1.9
16
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0
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0
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0.90
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11
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54
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0
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0
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0
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3
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0
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18
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1
0
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1.11
76824424--76824483
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18
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13
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1.11
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0
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2.0
24
82
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58
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31
0
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76861908--76861940
15
2.3
15
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75
15
0
9
1.03
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4.0
22
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13
65
33
7
3
55
1.45
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17
2.3
17
90
0
60
33
0
2
64
1.08
76864569--76864729
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3.6
45
93
4
265
26
24
15
33
1.95
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44
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9
221
28
19
25
26
1.99
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144
2.9
144
87
0
576
29
20
23
27
1.99
76876484--76876651
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1.9
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3
250
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19
27
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1.98
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63
33
6
3
56
1.42
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17
2.2
17
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0
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0
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1.10
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2.1
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28
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5
16
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0
0
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0
0
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0
50
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2
37
1.33
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15
2.9
15
89
3
59
59
0
7
33
1.25
76906108--76906278
72
2.4
72
87
4
249
54
12
5
26
1.60
76906703--76906750
18
2.7
18
96
0
87
39
12
12
35
1.81
76909823--76909851
11
2.6
11
100
0
58
41
6
10
41
1.66
76910849--76910921
33
2.2
33
78
4
76
41
0
2
56
1.14
76914129--76914196
23
2.8
24
77
8
75
39
1
1
57
1.17
76914222--76914285
23
2.7
23
78
4
65
45
0
1
53
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76914221--76914286
33
2.0
34
90
3
107
43
0
1
54
1.09
76917624--76917782
42
3.8
42
81
5
178
15
18
17
48
1.82
76917639--76917782
21
6.9
21
65
8
60
15
19
17
47
1.83
76933201--76933233
8
4.2
8
88
3
50
48
0
3
48
1.17
76933219--76933265
25
1.9
24
83
12
60
36
8
0
55
1.31
76933942--76933966
7
3.6
7
100
0
50
28
12
28
32
1.92
76939082--76939189
23
4.7
23
74
2
101
27
18
15
37
1.91
76940482--76940543
20
3.2
20
79
4
81
38
20
30
9
1.85
76940683--76940858
30
5.9
30
81
4
187
34
23
3
38
1.73
76940683--76940858
59
2.9
59
80
3
192
34
23
3
38
1.73
76941352--76941409
3
20.3
3
79
13
61
68
3
27
0
1.05
76941405--76941436
15
2.1
16
94
5
57
84
0
9
6
0.78
76941465--76941524
18
3.0
20
81
9
70
16
46
26
10
1.78
76941734--76941796
8
8.0
8
76
16
69
84
0
15
0
0.63
76941728--76941795
28
2.4
26
84
15
91
83
0
16
0
0.64
76941730--76941794
17
3.6
17
82
11
85
84
0
15
0
0.62
76941730--76941794
9
7.2
9
80
13
80
84
0
15
0
0.62
76941926--76941966
8
5.5
8
80
13
52
24
0
2
73
0.96
76941958--76941995
16
2.4
16
90
0
58
31
0
0
68
0.90
76942478--76942516
17
2.3
17
81
0
51
38
15
7
38
1.76
76942528--76942781
18
14.6
17
67
18
80
29
12
11
46
1.76
76942528--76942800
17
15.6
18
68
15
74
29
12
10
46
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76942515--76942781
53
5.1
52
74
11
165
31
12
10
45
1.77
76942535--76942780
35
7.1
34
72
13
150
30
12
10
46
1.76
76948783--76950216
405
3.6
398
82
5
1684
26
24
16
31
1.97
76955501--76955558
30
1.9
30
89
0
89
25
12
12
50
1.74
76959109--76959155
21
2.1
23
85
14
64
40
0
2
57
1.11
76963951--76964004
18
2.9
17
76
17
54
61
3
1
33
1.25
76963960--76964000
21
2.0
21
85
9
57
60
4
2
31
1.30
76967409--76967539
44
3.0
42
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8
138
27
24
19
29
1.98
76967550--76967987
218
2.0
218
90
1
700
25
26
20
28
1.99
76967805--76968119
132
2.4
132
87
0
450
25
24
20
28
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235