Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Dt_chr13
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  55873576

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  182  ( 21791 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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212
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
A
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Indels
Score
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1.79
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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0
0
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0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8628557--8628644
45
2.0
45
100
0
176
52
11
15
20
1.74
8633637--8633677
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
8638418--8638458
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
8641420--8641516
48
2.0
48
91
0
158
31
23
18
25
1.97
8643070--8643119
24
2.1
24
92
0
82
12
28
10
50
1.71
8643070--8643132
24
2.6
24
85
5
65
12
25
9
52
1.69
8645997--8646041
23
2.0
23
95
0
81
24
15
4
55
1.59
8658691--8658800
12
10.4
11
73
21
62
47
0
0
51
1.06
8658739--8658794
19
2.9
20
84
7
80
46
0
0
53
1.00
8658734--8658801
20
3.5
19
74
11
66
45
0
1
52
1.09
8658934--8659027
44
2.1
46
90
7
149
34
26
6
32
1.82
8659009--8659060
16
3.2
16
86
5
70
30
26
3
38
1.74
8660373--8660406
14
2.4
14
95
5
59
32
11
29
26
1.92
8661113--8661159
22
2.1
23
84
4
60
19
4
12
63
1.44
8662112--8662179
30
2.2
30
84
2
82
30
4
4
60
1.36
8662122--8662699
152
3.7
152
93
2
942
29
6
7
57
1.50
8662273--8662340
30
2.2
30
84
2
82
30
4
4
60
1.36
8662122--8662699
313
1.9
304
91
4
951
29
6
7
57
1.50
8690627--8690696
26
2.6
27
72
17
74
58
0
4
37
1.18
8690990--8691038
10
5.0
10
80
5
64
38
2
2
57
1.22
8690957--8691041
29
3.0
29
76
6
95
34
4
1
60
1.25
8691163--8691375
86
2.5
85
82
4
250
36
5
16
42
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8695550--8695594
19
2.3
20
96
3
83
48
11
11
28
1.73
8699473--8699602
10
14.0
9
69
17
72
29
3
3
63
1.27
8699544--8699602
9
6.4
9
74
16
50
27
1
5
66
1.22
8699488--8699591
54
1.9
55
86
5
149
28
3
1
65
1.21
8699487--8699585
19
5.3
18
75
15
78
29
4
2
64
1.23
8701876--8701927
24
2.2
23
83
10
61
23
7
7
61
1.49
8707071--8707146
35
2.3
32
79
6
80
34
21
21
23
1.97
8707166--8707202
14
2.5
16
87
12
53
35
37
13
13
1.84
8709212--8709533
45
6.8
45
73
11
239
37
17
23
22
1.94
8709393--8709581
53
3.7
53
77
11
223
37
17
24
21
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182