Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  228  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75652098--75652140
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16
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1
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2.1
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2
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62
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0
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0
0
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92
0
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2.4
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80
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0
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3.4
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12
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28
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1.47
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2.7
18
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1
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18
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1
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5
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1.51
75672932--75673238
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2.2
139
77
12
317
33
5
6
54
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75677023--75677064
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1.9
22
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0
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75683470--75683580
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2.5
44
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1.96
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3.8
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0
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29
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75688431--75688483
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4.0
13
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16
52
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20
1.71
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2.1
27
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1.21
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31
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60
1.29
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1.9
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1.31
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20
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0
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0.90
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0
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0
0
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2
2
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1.20
75701016--75701113
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2.4
40
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126
32
2
2
63
1.17
75701076--75701222
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6.1
25
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7
4
53
1.48
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3.9
11
78
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2
7
53
1.42
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2.0
21
90
4
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34
4
4
56
1.42
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17
2.0
18
88
5
54
28
2
2
65
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75701182--75701427
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4
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0
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1.9
19
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0
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1.46
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20
23
24
1.98
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2.0
13
100
0
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23
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0
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28
100
0
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0
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0
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10
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0
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27
1.96
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21
2.6
21
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1.53
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1.57
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22
2.0
23
91
4
74
24
6
4
64
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75764339--75764458
3
40.3
3
72
14
79
32
5
3
58
1.38
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2.0
22
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4
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2
0
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1.05
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16
2.1
17
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74
2
0
22
0.95
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35
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62
1.08
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2.9
27
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14
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11
21
18
1.79
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2.9
29
77
17
82
50
10
20
18
1.77
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28
4.5
28
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11
86
40
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27
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28
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0
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145
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29
6
1
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1.30
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3.8
70
78
12
237
26
8
4
60
1.45
75791343--75792125
89
8.8
88
76
6
634
32
15
21
30
1.94
75791401--75792124
133
5.4
132
84
4
769
32
15
22
30
1.94
75791343--75792125
44
17.6
44
76
6
621
32
15
21
30
1.94
75792517--75792595
16
4.8
16
71
22
65
64
3
25
6
1.34
75792567--75792595
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
75799824--75799852
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
75801776--75802020
44
5.4
44
75
8
213
29
15
23
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75803520--75803557
12
3.2
12
89
10
53
31
0
0
68
0.90
75803719--75803761
3
15.0
3
80
9
54
30
4
0
65
1.13
75803908--75803937
4
7.2
4
92
7
51
23
3
0
73
0.98
75812446--75812546
24
4.2
24
71
14
73
31
22
13
31
1.93
75812471--75812580
48
2.3
48
82
0
121
30
19
14
35
1.91
75817023--75817099
13
5.9
13
77
6
75
32
7
24
35
1.84
75817025--75817099
26
2.9
26
78
7
89
33
8
24
34
1.84
75818472--75818514
23
1.9
22
90
4
68
48
11
2
37
1.52
75826721--75826755
16
2.2
16
90
10
54
54
0
0
45
0.99
75826729--75826768
21
1.9
21
84
0
53
62
0
2
35
1.09
75827557--75827617
21
2.8
20
77
20
61
45
1
18
34
1.59
75829153--75829183
15
2.1
15
100
0
62
22
6
25
45
1.76
75830133--75830189
27
2.1
27
100
0
114
38
10
7
43
1.66
75831415--75831455
19
2.1
20
86
4
57
63
0
4
31
1.15
75832111--75832140
15
2.0
15
93
0
51
36
13
3
46
1.60
75832964--75833026
32
2.0
32
93
0
108
34
17
12
34
1.88
75833115--75833149
17
2.1
17
100
0
70
28
11
20
40
1.87
75834538--75834580
19
2.3
18
84
4
50
39
11
4
44
1.62
75835441--75835478
18
2.1
18
95
0
67
21
21
26
31
1.98
75835625--75835651
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
75838224--75838249
13
2.0
13
100
0
52
15
38
30
15
1.88
75841172--75841716
273
2.0
273
90
0
867
35
15
16
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
75843610--75843656
19
2.8
16
79
17
58
34
29
29
6
1.82
75843614--75843650
19
1.9
19
94
0
65
32
29
29
8
1.86
75843613--75843662
19
2.6
19
83
0
55
36
28
28
8
1.85
75855532--75855855
46
7.0
46
92
1
463
40
15
23
21
1.91
75859513--75859550
18
2.2
18
90
4
60
71
0
0
28
0.87
75864404--75864506
16
6.4
16
69
18
63
53
5
0
40
1.25
75864399--75864459
24
2.4
24
86
8
77
54
8
0
37
1.31
75864426--75864481
24
2.5
22
88
5
76
55
3
0
41
1.17
75864430--75864509
33
2.3
34
83
10
92
56
3
0
40
1.17
75867581--75867627
5
9.4
5
86
9
69
59
17
21
2
1.47

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255