Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  239  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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0
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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13
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0
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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36
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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3.2
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2
1
50
1.24
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1
1
50
1.21
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2.1
47
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49
1.32
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1
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10
2
77
1.09
78399139--78399213
31
2.5
29
85
6
96
9
9
2
78
1.05
78399234--78399298
21
3.4
18
80
13
69
13
3
4
78
1.03
78399348--78399490
37
4.0
34
73
13
119
38
2
2
56
1.26
78399637--78399711
20
3.7
20
65
28
59
48
10
4
37
1.57
78399728--78399837
34
3.1
35
79
7
116
60
3
2
33
1.29
78399900--78399924
13
1.9
13
100
0
50
72
0
4
24
1.02
78400037--78400084
21
2.3
20
86
10
62
70
0
6
22
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78400136--78400162
14
1.9
14
100
0
54
55
0
0
44
0.99
78400136--78400277
37
4.0
35
73
10
126
56
2
1
40
1.20
78400330--78400399
15
4.2
16
74
20
56
80
4
5
10
1.02
78400330--78400399
8
8.4
8
79
4
59
80
4
5
10
1.02
78400413--78400457
17
2.6
17
82
0
63
80
0
8
11
0.92
78400413--78400481
30
2.4
29
88
7
104
79
1
8
10
0.99
78400424--78400479
17
3.6
17
77
20
68
76
1
10
10
1.09
78400616--78400707
47
2.0
47
95
0
166
34
28
10
26
1.90
78402991--78403018
13
2.2
13
100
0
56
53
17
7
21
1.67
78403122--78403183
20
3.3
20
70
21
71
38
14
11
35
1.82
78405884--78405940
18
3.1
18
76
14
71
63
8
5
22
1.44
78405884--78405957
37
2.0
37
94
0
130
60
12
6
20
1.54
78405884--78405950
18
3.7
18
75
11
64
61
10
7
20
1.53
78409777--78409815
16
2.4
17
86
4
53
51
0
0
48
1.00
78409905--78409971
26
2.6
25
77
9
64
37
10
5
46
1.63
78409906--78409969
13
4.9
13
75
5
58
37
10
6
45
1.65
78417637--78417686
19
2.6
19
83
3
55
18
4
6
72
1.22
78422775--78422855
40
2.0
40
100
0
162
44
9
12
33
1.75
78431341--78431378
18
2.1
18
100
0
76
31
5
15
47
1.68
78432108--78432139
14
2.1
16
88
11
50
40
3
6
50
1.43
78432448--78432481
15
2.2
16
89
5
52
32
0
0
67
0.91
78436643--78436770
64
2.0
65
86
4
179
36
12
11
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78438451--78438493
17
2.6
17
92
3
70
20
6
4
67
1.33
78438451--78438500
17
3.1
17
88
5
59
20
8
4
68
1.32
78462415--78462460
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
78462422--78462466
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
78468127--78468153
13
2.1
13
100
0
54
44
22
25
7
1.79
78469948--78469980
16
2.1
16
88
11
50
21
6
12
60
1.53
78473459--78473519
25
2.6
25
82
12
76
70
1
8
19
1.21
78473675--78473713
20
1.9
21
84
5
53
51
0
17
30
1.46
78473849--78473912
3
21.7
3
96
3
121
65
0
0
34
0.93
78473997--78474055
18
3.2
18
75
20
59
66
3
1
28
1.18

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255