Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  28  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7546504--7546657
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0
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1.9
105
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24
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
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0
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22
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0
1
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1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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2
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1
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24
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1
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0
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39
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19
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21
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0
2
42
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7638760--7638807
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0
0
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1
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2.7
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27
2
10
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26
2.7
28
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28
2
8
60
1.39
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22
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2.0
21
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20
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4
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0
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260
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2.3
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57
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0
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0
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0
199
40
18
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1.83
7657312--7657347
14
2.6
14
91
8
56
19
2
0
77
0.88
7657311--7657346
18
1.9
19
94
5
65
19
2
0
77
0.88
7657388--7657476
34
2.7
34
81
13
91
38
0
2
59
1.10
7657412--7657510
12
8.7
12
75
22
58
38
1
0
60
1.04
7657419--7657524
21
5.0
21
81
13
76
38
0
0
60
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7657412--7657513
45
2.3
42
83
13
107
38
0
0
60
1.03
7657446--7657513
23
3.0
23
81
16
88
36
1
0
61
1.05
7657446--7657492
12
4.1
12
91
8
80
34
0
0
65
0.93
7657411--7657487
11
6.7
12
78
13
72
38
0
0
61
0.96
7657482--7657554
19
3.7
19
71
10
58
47
2
1
47
1.24
7657540--7657577
7
5.7
7
81
12
53
55
0
0
44
0.99
7657528--7657577
26
1.9
26
92
8
84
56
0
0
44
0.99
7657546--7657593
19
2.5
20
86
13
73
60
0
2
37
1.09
7657653--7657696
9
4.9
9
86
8
63
79
2
0
18
0.83
7657653--7657745
5
19.8
5
72
17
58
77
4
3
15
1.05
7657655--7657735
28
2.9
27
78
12
83
76
4
2
16
1.06
7657653--7657745
14
6.6
14
73
18
70
77
4
3
15
1.05
7658201--7658240
21
1.9
21
94
0
71
55
0
5
40
1.22
7658204--7658245
21
2.0
22
86
9
61
57
0
7
35
1.26
7659048--7659088
20
2.0
20
95
0
73
75
19
2
2
1.03
7659048--7659088
5
8.2
5
91
0
64
75
19
2
2
1.03
7659496--7659555
20
3.0
20
82
4
68
21
13
1
63
1.38
7659509--7659555
10
4.7
10
79
10
60
21
10
2
65
1.33
7660265--7660298
18
1.9
18
94
5
61
26
11
5
55
1.58
7662027--7662075
17
2.9
17
93
0
89
42
12
4
40
1.61
7663435--7663601
57
3.0
55
94
3
298
63
3
11
21
1.42
7667208--7667269
19
3.4
19
72
16
51
64
0
1
33
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7669620--7669762
70
2.0
70
100
0
286
34
12
4
48
1.61
7678749--7678801
24
2.2
24
83
6
63
60
7
7
24
1.50
7679190--7679236
22
2.3
21
85
10
62
48
17
12
21
1.79
7679389--7679414
10
2.6
10
100
0
52
57
0
0
42
0.98
7679409--7679462
25
2.0
28
83
16
71
46
1
1
50
1.23
7679453--7679485
16
1.9
18
88
11
52
42
0
0
57
0.98
7681200--7681429
90
2.5
91
82
6
281
33
17
12
36
1.87
7681538--7681599
29
2.1
29
85
5
81
64
3
1
30
1.19
7681773--7681836
19
3.4
18
78
16
60
28
7
1
62
1.32
7681799--7681856
28
2.1
28
86
0
80
29
5
0
65
1.14

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255