Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  229  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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136
27
8
32
30
1.87
76050825--76050851
13
2.1
13
100
0
54
14
37
33
14
1.88
76053866--76053959
47
2.0
47
100
0
188
27
10
21
40
1.86
76057059--76057143
42
2.0
42
100
0
170
23
22
23
30
1.99
76070618--76070644
11
2.5
11
100
0
54
22
7
18
51
1.70
76072040--76072233
92
2.1
92
88
5
286
44
4
4
46
1.41
76072211--76072309
52
2.0
52
80
11
118
45
6
2
46
1.39
76072266--76072299
17
2.0
17
94
0
59
44
5
0
50
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76072271--76072318
17
3.0
16
79
17
55
45
6
2
45
1.40
76072484--76072518
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
76072484--76072525
17
2.5
17
85
14
52
45
0
0
54
0.99
76072627--76072661
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
76072822--76072916
45
2.1
45
88
1
138
32
27
5
34
1.79
76072895--76072927
16
2.1
16
94
0
57
30
36
0
33
1.58
76073408--76073467
31
1.9
31
83
6
77
28
10
15
46
1.77
76076399--76076430
15
2.1
15
100
0
64
53
0
15
31
1.43
76077953--76077986
16
2.1
16
89
10
52
58
8
0
32
1.29
76078400--76078457
27
2.1
28
84
9
75
37
24
1
36
1.66
76079131--76079186
25
2.2
24
81
6
58
12
3
7
76
1.11
76081651--76081814
46
3.4
45
82
13
136
35
13
22
28
1.92
76081606--76081814
52
4.1
51
83
9
266
35
13
22
28
1.92
76081592--76081815
98
2.3
98
90
0
358
34
13
22
28
1.93
76081778--76081886
37
3.0
37
89
2
168
35
15
22
25
1.94
76082500--76082593
46
2.0
46
97
0
179
35
17
29
18
1.93
76084725--76084779
20
2.8
20
79
20
78
52
0
5
41
1.24
76084732--76084771
19
2.1
19
90
9
64
50
0
7
42
1.30
76084813--76084861
9
5.3
9
80
4
53
69
2
2
26
1.10
76084812--76084861
19
2.7
19
87
3
75
70
2
2
26
1.09
76085179--76085220
19
2.2
20
86
4
59
40
2
2
54
1.26
76085378--76085417
22
1.9
21
85
10
55
27
7
2
62
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76085696--76085724
3
9.7
3
100
0
58
31
0
0
68
0.89
76088644--76088674
3
10.3
3
92
0
53
29
0
3
67
1.06
76089690--76089747
29
2.0
29
86
0
80
55
8
3
32
1.47
76091315--76091378
31
2.1
31
88
5
94
40
12
12
34
1.81
76093443--76093515
10
7.4
10
74
11
62
27
1
2
68
1.11
76097218--76097272
22
2.3
24
84
12
69
47
3
3
45
1.38
76097288--76097320
15
2.2
15
94
0
57
42
3
0
54
1.15
76097375--76097475
5
20.2
5
91
0
166
55
0
3
40
1.18
76099558--76099588
11
2.8
11
100
0
62
58
6
29
6
1.48
76099849--76099891
17
2.6
16
82
13
52
37
0
2
60
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255