Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  237  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77705869--77705970
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2.0
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2.0
165
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86
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2.0
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5
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1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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14
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2.1
137
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24
1.98
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3.2
26
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1.81
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26
2.2
26
100
0
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1.83
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0
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1.61
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2.5
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0
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100
0
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33
0
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0
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2.4
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1.11
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2.2
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1
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1.11
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2.1
53
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23
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23
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4.7
47
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2
298
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15
24
21
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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373
29
14
25
30
1.95
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1.98
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28.3
3
74
9
66
60
2
8
29
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77831329--77831776
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22
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28
1.97
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22
20
29
1.98
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2.8
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2
180
31
20
18
28
1.97
77831312--77831780
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2.7
172
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28
22
18
30
1.98
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52
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0
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17
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12
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0
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110
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0
19
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1.24
77863379--77863423
20
2.2
20
92
0
72
44
8
2
44
1.47
77863500--77863550
25
2.0
25
85
7
68
47
0
0
52
1.00
77863501--77863561
29
2.1
30
81
9
72
49
0
0
50
1.00
77863517--77863549
16
2.0
17
88
5
50
48
0
0
51
1.00
77863610--77863668
29
2.0
30
93
3
102
54
8
3
33
1.48
77865051--77865075
11
2.3
11
100
0
50
92
0
8
0
0.40
77873132--77873186
24
2.2
24
87
3
74
40
18
20
21
1.92
77874019--77874086
15
4.4
15
73
10
57
7
22
1
69
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77874072--77874106
17
2.0
18
88
5
54
8
8
5
77
1.13
77874109--77874156
16
3.0
15
79
11
51
45
2
0
52
1.12
77874464--77875059
302
2.0
302
97
0
1131
30
19
16
32
1.95
77879514--77879562
25
2.1
24
85
14
68
44
10
4
40
1.57
77882011--77882066
24
2.3
24
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0
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41
3
16
39
1.65
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5
6.0
5
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7
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38
0
0
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39
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39
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8
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23
20
27
28
1.99
77892712--77892747
5
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5
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0
0
61
0.96
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13
102
22
21
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30
1.99
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2.9
31
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0
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25
10
20
44
1.82
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16
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37
3
0
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1.13
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20
2.7
19
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16
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37
7
1
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1.41
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11
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0
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59
0
0
40
0.97
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3
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3
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32
0
0
67
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0
0
33
0.92
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3
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3
100
0
50
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0
0
32
0.90
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16
1.9
16
93
0
53
48
3
0
48
1.17
77919029--77919070
17
2.4
18
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7
52
30
0
0
69
0.89
77923579--77923633
20
2.7
20
75
13
67
49
1
0
49
1.11
77925096--77925169
31
2.4
31
97
0
139
45
18
17
17
1.85
77925309--77925354
19
2.4
18
85
7
56
36
2
4
56
1.31
77928297--77928330
17
2.1
16
89
10
52
47
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77929917--77929945
12
2.4
12
100
0
58
6
24
41
27
1.80
77942214--77942321
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
77943196--77943230
9
3.9
9
84
0
52
2
17
0
80
0.84
77943196--77943235
18
2.2
19
90
4
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2
15
2
80
0.93
77943239--77943311
5
14.6
5
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20
64
56
4
0
39
1.19
77943240--77943282
19
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19
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58
0
0
41
0.98
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24
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4
0
36
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0
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2
17
0
80
0.84
77949341--77949380
18
2.2
19
90
4
64
2
15
2
80
0.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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