Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  220  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73212965--73213170
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1.9
130
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20
19
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1.97
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190
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0
0
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0
0
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2.0
25
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23
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4.3
45
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0
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41
15
18
24
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73275817--73276097
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28
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97
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0
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37
1.16
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100
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2
0
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2
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10
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60
3
3
33
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2.9
27
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2
2
35
1.24
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0
0
50
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3
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3
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8
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0
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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0
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53
6
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0
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83
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1
26
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2
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32
1.96
73353927--73354412
213
2.3
215
81
7
542
27
16
23
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73354580--73354763
72
2.5
72
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2
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17
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1.97
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16
2.0
16
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0
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40
40
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12
1.68
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20
2.3
20
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0
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0
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63
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0
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1
5
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2.1
20
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0
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20
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20
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0
62
20
30
30
20
1.97
73377892--73378066
46
3.8
46
79
13
214
21
21
29
28
1.98
73380419--73380461
17
2.5
17
84
3
50
6
13
2
76
1.08
73385130--73385164
14
2.4
15
90
4
54
54
0
2
42
1.15
73385466--73385498
16
2.0
17
94
5
59
84
0
15
0
0.61
73391440--73391629
96
2.0
97
89
1
292
34
8
20
36
1.83
73393215--73393261
19
2.6
19
86
6
62
51
4
2
42
1.33
73397500--73397536
16
2.3
16
85
0
56
70
0
2
27
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73399031--73399110
37
2.1
38
81
6
92
36
18
18
26
1.94
73399983--73400049
4
16.0
4
83
11
73
1
25
2
70
1.10
73404216--73404361
68
2.1
68
97
0
274
43
4
17
34
1.70
73407526--73407557
5
6.6
5
92
7
57
18
0
0
81
0.70
73407526--73407556
9
3.3
9
91
8
53
19
0
0
80
0.71
73413172--73413386
45
4.9
45
80
6
163
34
26
16
22
1.95
73413210--73413386
45
3.9
45
83
5
187
35
25
16
22
1.95
73415954--73416023
26
2.7
27
89
8
94
47
2
1
48
1.25
73416006--73416080
37
2.1
35
83
14
91
53
2
2
41
1.29
73415862--73416064
48
4.3
47
68
18
150
50
2
3
43
1.34
73416480--73416519
19
2.1
19
85
0
53
32
2
5
60
1.32
73419837--73419916
37
2.2
38
81
4
101
35
7
23
33
1.83
73421086--73421110
12
2.1
12
100
0
50
44
16
8
32
1.76
73423084--73423234
51
3.0
50
83
3
180
29
24
19
26
1.99
73428251--73428473
40
5.6
40
84
5
229
24
20
27
27
1.99
73428326--73428508
79
2.3
80
80
1
208
25
20
27
26
1.99
73436106--73436328
40
5.6
40
84
5
229
24
20
27
27
1.99
73436181--73436363
79
2.3
80
80
1
208
25
20
27
26
1.99
73438551--73438607
21
2.7
21
71
13
53
28
24
35
12
1.91
73452906--73452935
6
5.0
6
100
0
60
33
0
66
0
0.92
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39
6.2
39
78
0
137
32
27
19
20
1.97
73454318--73454561
78
3.1
78
79
0
245
32
27
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
73454318--73454561
117
2.1
117
81
0
290
32
27
19
20
1.97
73458730--73458910
19
9.8
19
86
7
275
35
11
16
37
1.84
73458736--73458917
73
2.5
73
88
6
264
36
10
15
36
1.83
73458730--73458910
54
3.3
54
92
2
290
35
11
16
37
1.84
73464624--73464664
21
2.0
21
85
0
55
87
4
4
2
0.72
73464624--73464666
23
1.9
22
85
4
59
88
4
4
2
0.70
73465626--73466391
44
17.4
43
73
15
466
28
15
26
29
1.96
73465609--73465971
132
2.8
130
88
4
550
28
15
26
29
1.96
73465757--73466367
176
3.5
177
90
2
955
29
14
26
28
1.95
73465766--73466500
352
2.1
350
85
5
939
29
15
26
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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