Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: A04
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  82679320

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   

This is table  25  of  255  ( 30512 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6748406--6749347
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2.0
105
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1.95
6750380--6750444
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2.0
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0
130
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6762280--6762323
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6763856--6763890
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8
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1.93
6763856--6763887
12
2.8
12
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53
60
0
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2.5
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0
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60
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2.0
131
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21
73
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0
1
38
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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9
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30
3
0
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1.16
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20
2.3
20
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3
65
24
6
0
68
1.13
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2.6
26
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36
2
0
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1.11
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2.0
20
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0
0
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1.98
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22
2.6
24
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12
72
59
0
1
39
1.08
6810242--6810284
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3.9
11
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8
52
62
0
2
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2.0
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6815355--6815415
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2.5
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2.0
44
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35
17
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1.95
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1.8
110
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327
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17
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23
1.96
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23
1.9
24
86
13
67
44
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24
22
1.81
6825808--6825842
18
1.9
18
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2
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1.37
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15
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70
0
0
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0.88
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2.0
25
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4
64
54
8
6
32
1.54
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3.2
25
71
10
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2
14
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1.58
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11
3.4
11
92
0
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45
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1.76
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78
2.0
78
97
0
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27
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28
1.85
6843511--6843543
16
2.1
16
100
0
66
33
18
6
42
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.96
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41
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41
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328
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23
22
19
1.96
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1
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0
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2.6
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2.0
20
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0
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1.51
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20
0
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1.52
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19
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1.56
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19
0
33
1.56
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4.5
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17
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0
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0
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2.1
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0
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16
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1.44
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2.0
16
93
0
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0
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2
19
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0
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3.8
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0
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29
1.97
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39
3.9
39
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2
254
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2
20
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1.64
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2.1
35
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2.3
19
95
4
77
21
26
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6907695--6907734
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19
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37
0
0
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2
2
29
1.14
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100
0
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0
0
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3.7
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15
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2
1
36
1.17
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25
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23
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21
59
60
2
1
35
1.18
6922251--6922327
39
2.0
39
87
9
115
59
2
1
36
1.19
6922260--6922327
9
8.4
8
72
19
52
60
1
1
36
1.15
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3.0
12
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0
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0
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1.37
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16
2.3
16
90
0
56
51
10
0
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1.37
6922386--6922417
12
2.7
12
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0
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0
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1.35
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0
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1.42
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2.0
13
100
0
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14
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14
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0
52
70
2
2
25
1.10
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1
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28
22
19
29
1.98
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24
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24
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0
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0
26
0
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63
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63
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7
215
0
24
0
74
0.89
6943360--6943395
13
2.8
14
84
16
51
27
25
0
47
1.52
6943551--6943635
21
4.0
21
80
4
80
38
25
21
14
1.91
6943549--6943623
21
3.5
22
83
7
91
38
26
21
13
1.90
6943919--6943972
15
3.5
15
87
2
81
51
11
0
37
1.37
6943922--6943980
30
2.0
28
90
6
91
55
10
0
33
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6948862--6948919
11
5.9
10
73
16
50
65
0
1
32
1.03
6949463--6949520
29
2.0
28
81
15
66
27
1
3
67
1.17
6957673--6957703
12
2.5
12
94
5
53
58
3
0
38
1.15
6964828--6964861
17
1.9
18
94
5
61
11
47
29
11
1.76
6975135--6975404
136
2.0
135
95
0
486
38
12
18
30
1.88
6982820--6982853
16
2.1
16
100
0
68
44
17
14
23
1.86
6985381--6985408
11
2.5
11
100
0
56
25
7
0
67
1.15
6986194--6986272
40
2.0
40
84
0
104
26
22
35
15
1.94
6988326--6988378
19
2.8
19
79
0
61
20
18
20
39
1.92
6990626--6990661
18
2.0
18
100
0
72
33
11
11
44
1.75
6994858--6994929
36
2.0
36
81
5
83
40
9
4
45
1.56
7004435--7004498
32
2.0
32
100
0
128
40
12
18
28
1.87
7014474--7014511
8
4.8
8
96
0
67
76
0
0
23
0.79
7015077--7015115
7
5.7
7
90
3
62
23
17
12
46
1.83
7015071--7015115
21
2.2
20
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4
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22
20
11
46
1.81
7018004--7018030
13
2.1
13
100
0
54
48
14
14
22
1.81
7030387--7030433
6
8.0
6
76
4
51
23
17
14
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1.85
7033836--7033871
18
2.0
18
100
0
72
33
22
11
33
1.89
7034630--7034663
16
2.2
16
89
5
52
55
0
0
44
0.99
7036383--7036422
20
2.1
19
90
4
62
42
5
5
47
1.47
7038030--7038065
18
2.1
16
90
10
54
80
0
16
2
0.83
7038345--7038418
20
3.5
20
69
25
62
47
4
17
31
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7038344--7038431
44
2.0
44
95
0
158
46
3
19
30
1.66
7044843--7044890
25
1.9
25
86
0
69
33
25
16
25
1.96
7044927--7044977
20
2.5
20
96
0
93
35
9
21
33
1.86
7045022--7045127
24
4.4
24
91
3
169
28
21
21
28
1.99
7045023--7045141
24
5.0
23
90
5
157
27
22
21
27
1.99
7045334--7045397
31
2.1
31
90
0
101
35
15
23
25
1.94
7060762--7060820
30
2.0
29
86
3
82
28
25
6
38
1.81
7065187--7065271
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1.9
44
97
0
161
44
24
12
17
1.84
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2.0
21
85
0
55
21
17
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19
1.90
7068315--7068374
30
2.0
30
87
6
86
28
25
6
40
1.80

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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