Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_D01
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  62811768

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   

This is table  211  of  211  ( 25234 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62617364--62618261
288
3.1
287
89
1
1327
43
19
11
25
1.84
62628556--62628615
22
2.7
23
82
12
72
60
13
8
18
1.58
62629642--62629680
21
1.9
20
85
15
53
20
7
7
64
1.45
62630106--62630240
31
4.2
31
77
17
109
63
0
1
34
1.03
62630106--62630203
11
9.6
11
68
21
54
62
0
1
36
1.02
62630164--62630238
30
2.6
30
85
12
95
64
0
2
33
1.08
62630149--62630238
30
3.2
28
80
20
93
64
0
2
33
1.06
62630228--62630252
7
3.6
7
100
0
50
88
0
0
12
0.53
62630113--62630245
67
2.0
67
81
11
157
63
0
1
34
1.03
62630107--62630252
78
1.9
78
80
12
174
65
0
1
32
1.01
62633138--62633181
22
2.0
23
86
4
63
68
2
2
27
1.14
62635303--62635404
50
2.1
49
90
1
159
9
25
7
56
1.58
62638352--62638407
29
1.9
29
85
0
76
44
7
0
48
1.30
62638856--62638881
11
2.4
11
100
0
52
38
7
0
53
1.30
62638847--62638933
41
2.2
40
89
6
131
34
2
0
63
1.07
62638880--62638913
17
2.0
17
88
0
50
35
0
0
64
0.94
62638905--62638953
22
2.2
21
82
10
62
34
0
4
61
1.15
62657381--62657451
20
3.5
20
79
9
65
40
35
7
16
1.76
62658868--62658924
10
5.9
10
78
15
57
56
0
0
43
0.99
62658858--62658981
39
3.2
40
88
8
191
61
0
0
38
0.96
62661702--62661756
4
13.8
4
96
0
92
21
0
27
50
1.49
62669236--62669260
11
2.3
11
100
0
50
28
28
0
44
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
62669707--62669758
23
2.3
23
82
0
59
65
7
25
1
1.30
62698465--62698499
17
1.9
19
88
11
56
40
0
5
54
1.24
62722402--62722434
3
11.0
3
100
0
66
33
0
33
33
1.58
62722603--62722630
6
4.7
6
100
0
56
50
14
0
35
1.43
62727868--62727906
19
2.1
19
85
4
53
69
2
0
28
1.02
62750378--62750402
13
1.9
13
100
0
50
40
12
16
32
1.84
62762141--62762172
16
2.0
16
100
0
64
56
25
0
18
1.42
62766672--62766702
4
7.8
4
100
0
62
25
0
22
51
1.48
62773909--62773971
31
2.1
29
91
5
99
31
9
11
47
1.71
62791061--62791091
6
5.2
6
100
0
62
16
35
16
32
1.91
62810227--62810256
6
5.2
6
92
8
53
33
16
33
16
1.92
62810227--62810256
11
2.6
11
94
5
51
33
16
33
16
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211

The End!